不过模板越少,PCR效果会打折扣的。
还有,模板少,另外其它组分的用量不变的话,引物二聚体会增多,引物非特异性结合的概率会小小增高,当然,最主要的还是影PCR产量。
刚才看了,你是做RAPD,模板少的话条带会比较少的,多态性也不太容易出来,要么你再提DNA,要么你降低退火温度,提高循环数试试
模板DNA浓度主要看你的PCR扩增体系所使用的酶:
1、一般普通的酶,DNA模板量在50到100ng都可以扩增出来的
2、高效一点的酶,几ng也可以扩增出来的。
1、PCR反应步骤:类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成
2、PCR反应五要素:①引物(Primer)、②酶 (Taq DNA Polymerase) 、③dNTP(dATP, dGTP, dCTP, dTTP)、④模板(Template)、⑤Mg2+(Magnesium)
3、引物: 引物是PCR特异性反应的关键,PCR 产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。
4、酶及其浓度:目前有两种Taq DNA聚合酶供应,一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然酶,另一种为大肠菌合成的基因工程酶。催化一典型的PCR反应约需酶量2.5U(指总反应体积为100ul时),浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少。
5、模板核酸的量与纯化程度,是PCR成败与否的关键环节之一,传统的DNA纯化方法通常采用SDS和蛋白酶K来消化处理标本。SDS的主要功能是: 溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,SDS 还能与蛋白质结合而沉淀; 蛋白酶K能水解消化蛋白质,特别是与DNA结合的组蛋白,再用有机溶剂酚与氯仿抽提掉蛋白质和其它细胞组份,用乙醇或异丙醇沉淀核酸。提取的核酸即可作为模板用于PCR反应。一般临床检测标本,可采用快速简便的方法溶解细胞,裂解病原体,消化除去染色体的蛋白质使靶基因游离,直接用于PCR扩增。RNA模板提取一般采用异硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNA。
6、PCR扩增条件包括温度、时间和循环次数。
要看用的是什么模板了,pcr的灵敏度很高,几pg的DNA就能检测出来,一般用pcr产物或者质粒做模板,只需要1ng左右就可以,如果是基因组或者cDNA做模板,模板量可适当增加。PCR指聚合酶链式反应,是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点,是能将微量的DNA大幅增加。因此,无论是化石中的古生物、历史人物的残骸,还是几十年前凶杀案中凶手所遗留的毛发、皮肤或血液,只要能分离出一丁点的DNA,就能用PCR加以放大,进行比对。这也是“微量证据”的威力之所在。
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