1、温度：绝大多数微生物最适生长温度为25℃~37℃；在最适生长温度范围内，微生物生长速率随温度上升而加快；超过最适生长温度后，微生物生长速率急剧下降，原因是细胞内蛋白质和核酸等发生不可逆破害。
2、pH值：每种微生物最适pH不同，超越最适pH，影响酶活性、细胞膜温度性等，从而影响微生物对营养物质的吸收。
3、氧：依据对氧的需求，微生物分为好氧性微生物（如多数细菌、大多数真菌）、厌氧性微生物（如某些链球菌、某些产甲烷杆菌）、兼性厌氧性微生物（如酵母菌）。
4、化学环境：一些化学药品及拮抗菌等可对微生物的生长繁殖、生理生化过程产生影响。
5、渗透压。
6、紫外线（辐射）。
菌落总数平板计数原则：
1、无菌操作：操作中必须有“无菌操作”的概念，所用玻璃器皿必须是完全灭菌的，不得残留有细菌或抑菌物质。所用剪刀、镊子等器具也必须进行消毒处理。样品如果有包装，应用75%乙醇在包装开口处擦拭后取样。
操作应当在超净工作台或经过消毒处理的无菌室进行。琼脂平板在工作台暴露15分钟，每个平板不得超过15个菌落。
2、采样的代表性：如系固体样品，取样时不应集中一点，宜多采几个部位。固体样品必须经过均质或研磨，液体样品须经过振摇，以获得均匀稀释液。
3、样品稀释误差：为减少样品稀释误差，在连续递次稀释时，每一稀释液应充分振摇，使其均匀，同时每一稀释度应更换一支吸管。
在进行连续稀释时，应将吸管内液体沿管壁流入，勿使吸管尖端伸入稀释液内，以免吸管外部粘附的检液溶于其内。
为减少稀释误差，SN标准采用取10mL稀释液，注入90mL缓冲液中。
平板计数的局限性
平板计数法只能测定那些可培养的微生物，往往低估土壤中实际存在的微生物数量，而且干扰因素很多，如土壤悬液中原有的菌聚集在一起或附在土粒上，未被完全分散，所以平板上形成的菌落数比实际菌落数低。
采用的培养基或培养条件有选择性，难以平等地区分所有的微生物，而且稀释液可能会抑制某类（种）微生物。为了更准确地阐述平板菌落计数的结果，现倾向于用菌落形成单位表示样品中的微生物数量。
以上内容参考：百度百科-平板菌落计数法、百度百科-平板计数法
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