二羟丙酮磷酸和磷酸甘油醛最终将被氧化成丙酮酸，丙酮酸进入柠檬酸循环，最终被分解成二氧化碳和水（原葡萄糖中的氧原子全部到二氧化碳分子中），同时生成NADH、GTP、FADH2.GTP和ATP可以互相转化，NADH和FADH2进入呼吸链在O2的参与下被氧化,同时生成ATP，这里也会生成水，其中的氧原子来自于氧气，所以最终，O18将出现在二氧化碳分子中。
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糖原磷酸解时产物为葡萄糖-1-磷酸，水解时产物为葡萄糖。葡萄糖-1-磷酸可以异构为葡萄糖-6-磷酸，再进入糖酵解途径降解，葡萄糖通过糖酵解途径降解时，首先需要被激酶磷酸化生成葡萄糖-6-磷酸，这一不需要消耗atp，因此糖原选择磷酸解可以避免第一步的耗能反应。因为糖要经过磷酸化才能被利用、转化、合成多糖。例如寡糖和多糖合成原料是尿苷二磷酸葡萄糖、腺苷二磷酸葡萄糖。
呼吸作用中糖酵解葡萄糖要被激化形成6-磷酸葡萄糖，然后再经过一系列的磷酸化才能被生成丙酮酸。
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