不过，二者拥有的优势学科有所不同。西交大的两个国家重点学科是法医学、泌尿外科；而第四军医大学的重点学科分别是神经生物学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、人体解剖与组织胚胎学、病原微生物学、病理学与病理生理学、内科学（消化系病）、内科学（传染病）、外科学（骨外）、外科学（神外）、外科学（胸心外）、皮肤病与性病学、口腔临床医学、军事预防医学、航空、航天与航海医学。此外，第四军医大学的影像医学与核医学、外科学（普外）、外科学（整形）等也接近国内顶尖水平。
考生可以根据想学哪方面专业去考虑。
还有，就是第四军医大学属于军校招生，是提前批录取，毕业后包分配。而西交大一般是在本科一批招生。也就是说，考生可以在提前批报考第四军医大学，然后在本科一批志愿中同时填报西交大，增加录取几率。
PS：录取到西交大和第四军医大学任何一所都不错。
第四军医大要好一些。
截至2018年6月，学校机关设一办七处，下辖基础医学院、研究生院、空军航空医学研究所（北京）、空军卫勤训练基地，7个专业院系及3所附属医院。
博士后流动站10个，博士学位一级授权学科11个、自主设置目录外二级学科10个、交叉学科5个，二级授权学科65个，硕士学位授权一级学科12个，二级（三级）学科69个。
根据2019年4月学校官网显示，全校有教、医、研人员3000余名，其中正副教授（含相当职务）近800名，中国科学院院士1名、工程院院士4名、国家“万人计划”入选者12名、国家“973”首席科学家7名，国家百千万人才工程入选对象10名、国家有突出贡献中青年专家7名。
国家杰出青年基金获得者20名、全国优秀科技工作者13名、“求是”杰出青年实用工程奖获得者5名、教育部新世纪优秀人才支持计划入选者14名、军队专业技术重大贡献奖获得者2名、军队杰出专业技术人才奖获得者5名。
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