1、上海交通大学医学部（原上海第二医科大）
3、上海华山医学院。
一、简述
1、上海交通大学医学院（Shanghai Jiao Tong University School of Medicine）由中华人民共和国教育部、中华人民共和国卫生部和上海市人民政府共建，位列“211工程”、“985工程”，入选中国首批“卓越医生教育培养计划”，是国家级临床技能实验示范中心学科组长单位。
2、上海交通大学医学院前身是由圣约翰大学医学院、震旦大学医学院、同德医学院于1952年全国高等学校院系调整时合并而成的上海第二医学院；1985年，更名为上海第二医科大学。1997年。
3、学校通过了“211工程”立项。2005年7月18日，上海交通大学与上海第二医科大学合并，成立了由教育部、上海市人民政府重点共建的上海交通大学医学院，进入“985”高校行列。2010年11月，学院成为卫生部与教育部合作共建的第一批十个重点高校中的一员。
4、截至2013年12月底，学院拥有重庆南路、闵行、南汇三个校区，下设23个学院（系）、14所附属医院、1所卫生学校，开办10个本科专业（方向）；有教职医务员工22707名，专任教师634名；有在校学生6828名，其中本科及长学制学生2723名，研究生3842名，留学生263名。
二、科研概况
1、截至2013年12月底，学院共获得国家级科技成果奖67项，其中国家最高科学技术奖1项，国家自然科学奖5项，国家技术发明奖10项，国家科技进步奖51项。
2、2010-2013年，学院国家自然科学基金项目数累计达1372项，2013年获得497项，连续四年稳居全国医学学科第一。
3、2012年度，发表SCIE论文1980篇，医学学科SCI收录论文数再次名列全国一，同比增长29.7%。
4、2005年-2012年，学院获全国优秀博士学位论文4篇，提名奖16篇。
5、2008-2013年，学院以第一完成单位共获得国家级科技成果奖11项，市（部）级科技成果奖162项，王振义院士获2010年度国家最高科学技术奖。
6、2009-2013年，学院在SCI收录中国医学领域科技论文数量机构排名中连续五年荣获第一位。
交大医学院明显更好。复旦医学院在被合并前是上海医科大学，交大医学院的前身是上海第二医科大学。两者在被合并之前，确实是上医大实力比上二医强一些。但合并后至今，交大医学院的实力已经迅速超过了复旦医学院，不仅临床医学和口腔医学继续比复旦强，基础医学也和复旦不相上下。
最新的医学院排名中，北大医学部全国第一，协和医科大学第二，交大医学院第三，复旦医学院第四，排名也真实反映了医学院改革的成效和走势。由于复旦合并了上医大后，强制拆分成好几个平级院系，实力大打折扣是事实，而交大医学院却继续稳步发展中，以后两者的差距只会越来越大。
附属医院方面，交大也好于复旦，交大附属医院基本均为三甲医院，上海评级最好的医院也是交大附属瑞金医院，再加上仁济、新华等，三甲数量明显超过复旦所有的中山华山。
而就招生而言，交大北大清华都是采取医学院与本部录取分分开的方式，医学院录取分比本部低好几分都是很正常的，几年招生下来效果非常好，反观复旦医学院与本部同分录取，反而将医学搞得发展停滞不前。从今年开始复旦医学院也要和本部分开录取分数线了，这是回归正途的举措。
总之，交大医学院更好。
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