原来每个人的细胞表面都带有属于自己的独特的抗原，这是由许多基因控制的、性状多样的抗原，称为人类组织相容性抗原，简称HLA，是一组多种抗原的总称。除遗传密码完全相同的同卵双生子女和“克隆人”与其模型人以外，人与人之间的HLA各不相同，这就像人与人之间的脸蛋和指纹不会完全相同一样。理所当然，当外来的器官进入人体后，只要免疫威力能达到的地方，免疫系统就会识别出外来器官上的抗原与自己身体内的抗原不同，对其加以攻击，最终引起移植进来的器官功能迅速衰竭、死亡，称排斥反应。按排斥反应发生的程度和时间，排斥反应可分为超急性、急性和慢性三种。
当移植了他人的肾脏，这种“非己”的器官存在于受者体内，就是受到体内以淋巴细胞为主的免疫活性细胞的“攻击”。这就是医学术语所称的排斥反应，其机制是很复杂的生物学现象。现代医学研究证明：临床上肾移植出现排斥反应，绝大多数是免疫因素综合作用的结果。在不同类型的排斥反应当中，细胞与体液免疫所起的作用不一样。一般来讲，超急排斥反应是体液免疫反应的后果；急性排斥反应的早期是以细胞免疫反应为主，晚期则是以体液免疫反应为主；慢性排斥反应是持久的体液和细胞反应的后果，以体液免疫为主。由于尿毒症病人接受的是非同卵双生的供肾，组织兼容性差。因此，术后发生排斥反应是绝对的，是经常存在的。但有出现的早与晚、轻与重及频率之区别。如果选择最佳的组织配型，辅以免疫抑制剂治疗，大部分的排斥反应是可以防止和逆转的
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