1、高胰岛素血症起源
儿童期的肥胖会增加胰岛素的释放，而胰岛素和促性腺激素联合作用，促进卵巢中雄激素的合成，进而可能导致排卵障碍和多毛症。成人期高胰岛素血症可以增加卵巢中雄激素的分泌和诱导卵泡发育的早期停滞。胰岛素还可以抑制肝脏中性激素结合球蛋白的产生，继而可能增加血中的的游离雄激素水平，导致PCOS的一些特征。
2、基因异常起源
30-50％的PCOS患者的直系亲属也被诊断有PCOS。同卵双胞胎中的研究发现的PCOS共患率高达65％。用候选基因策略进行的基因分析已经发现了超过100种可能跟PCOS相关的候选基因，并不断有研究报道候选基因与PCOS的功能联系。然而，PCOS的遗传学风险评分的预测价值依然很弱，提示关键基因尚未被找到或者基因异常不是疾病起源。
3、表观遗传学改变
除了基因的改变，有时可能发生由不改变DNA主序列、由修饰造成的基因表达的改变，即表观遗传学改变，包括DNA甲基化和组蛋白修饰。在需要的时候，这些改变可以在没有持续的刺激源的情况下持续终生。有假说认为PCOS起源于表观遗传学的改变。
4、宫内高雄激素暴露
成人疾病胎儿起源的假说，又叫Barker假说，认为宫内发育时的不利因素的影响可以导致永久的生理和代谢的异常。胎儿在胚胎发育的重要时期暴露于雄激素会导致雌性和雄性子代的解剖结构和行为的男性化。临床和临床前的研究提供的证据都支持宫内高雄暴露增加了雌性子代在青春发育开始后发展为PCOS表型的倾向。
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