南京大学医学部 附属医院：鼓楼医院（三级甲等）
东南大学医学院（原铁道医学院） 附属医院：中大医院（三级甲等）
专业性医科大学，2所
南京医科大学 主要附属医院：江苏省人民医院（三级甲等）、南京医科大学附属第二医院（三级乙等）、江苏省肿瘤医院、南京市口腔医院、江苏省口腔医院、南京市脑科医院、南京市第一医院（三级甲等）、南京市儿童医院（三级甲等儿童医院）、江苏省妇幼保健医院
南京中医药大学 主要附属医院：江苏省中医院（三级甲等中医院）、江苏省第二中医院、南京市中医院（三级甲等中医院）
军队院校，1所
解放军第二军医大学南京军医学院（以培养军队医疗系统高级护理人员出名）
民办本三院校，2所
南京医科大学康达学院
南京中医药大学翰林学院
中国药科大学是药学类院校，没有医学类专业。
南京的医学类学校，在全国都只能算二流，要说实力谁弱谁强，无可比性，南医大应该是综合实力最强的，医学类学科门类全，附属医院多且医疗科研实力雄厚，但是南京大学医学部恐怕在基础医学和临床医学方面也不错。
而南京中医药大学则是中医学类院校，因为是国家中医药人才培养基地和留学生基地，因此在全国的影响力反而比南京医科大学大。
总的来说，学临床医学或基础医学，最佳是南医大和南大医学部，学中医，则是中医药大学，学药学，惟有中国药科大学！
1、南京医科大学康达学院创建于1999年，是由南京医科大学自主创办并经省教育厅批准的公有民办二级学院。2005年，经教育部批准设立为独立学院。
2、2011年，南京医科大学和连云港市政府签署合作办学协议。2013年9月，南京医科大学康达学院正式从南京迁址连云港办学。 学院设有基础医学部、临床医学部、护理学系、药学部、康复医学部、人文管理学系等12个教学机构，拥有一批在国内外享有盛誉的专业带头人；现已建有28所临床医学院、附属医院和教学医院，同时共享南京医科大学25所附属医院的教学资源。学院现有专兼职教师1043人，其中副高以上职称253人；自有教职工349人，具有博士、硕士学位的教师占85%以上。 学院设有临床医学、预防医学、药学、医学影像技术、护理学、公共事业管理、康复治疗学、医学检验技术等15个专业19个方向。目前学院在校生人数7500人。学院各项教学、实验及生活设施先进齐全。图书馆文献收藏量近80万册，同时作为南京医科大学图书馆的分馆，学院学生可以共享南京医科大学图书馆丰富的馆藏资源。
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