1.水和土壤的性质不同
水和土壤中的电解质、有机物、酸碱度、清洁度都不同，进一步影响了各种粮食水果蔬菜畜肉品质上的差异，当人进食饮水后刺激了各系统的生理功能，造成了消化、泌尿、循环、神经系统的不适。
2.微生态菌群失调
人的肠道内寄生着大量的细菌，构成了肠道的微生态环境，这与饮食结构和习惯有着很大的关系，当到了一个新地方，膳食结构发生变化，肠道的菌群确不能及时调整，就容易造成消化系统的功能异常。
3.地理因素影响
海拔高度、纬度、气候、日照、磁场、湿度、温度、昼夜时差……这一切的改变都容易使人产生不适。
4.精神心理因素的影响。
风俗习惯、饮食文化、生活条件的特别是语言的改变，容易使人的精神、情绪受到影响，导致失眠、头痛等。
5.过敏反应
有些过敏体质的同学到了新环境也许会遇到新的过敏源，或者由于卫生条件较差，蚊虫叮咬，可能出现皮疹等过敏翻译。
怎样克服水土不服？
1.做好思想准备
在我看来水土不服有两种，一种是生理上的，一种是纯心理上的。心理上的无非是一个社会适应能力的问题，作为学生应当加强自我调试，保持乐观的心态，及时排解内心的孤独和思乡之请，广泛交友，尽快融入新的集体（呵呵，上贴吧来找吧友倾诉也可以啊），此外也可以多和家长和老师沟通，必要时也可求助于学校的心理咨询医生。
2.积极预防疾病
特别是预防胃肠道和呼吸系统疾病。饭前要洗手，不要吃街边食品（特别是当地的小吃，一定要在有卫生许可证的地方买），注意了解当地的气候规律，注意昼夜温差，及时添减衣物。因为土质、水质的原因而造成腹泻腹胀的时候应该多饮用些白开水，不吃冷饮和不容易消化的食物，不喝生水和不明来源的食物。
3.合理安排时间，加强身体锻炼
刚到学校难免看什么都新鲜，喜欢到处走走逛逛，但也要注意休息，不要熬夜和睡懒觉。还要注意顺应气候条件来锻炼身体，并注意休息和保养。很多北方同学到了南方上学，马上要面临的就是没有暖气的冬天，这会让很多北方的同学不适应，甚至长冻疮等，这就应当提早进行耐寒锻炼，促进血液循环。
4.吃刺激少、易消化、养胃食物
中医认为水土不服与脾胃虚弱有关。初来异地，可以先吃些容易消化、刺激少的食物，如豆腐、汤、粥等。此外可以吃些蜂蜜、红枣、莲子、花生一类健脾胃的食物。
5.选择与原口味相近的食物
特别是小顾不推荐以往不吃辣椒的同学到了某些口味较辣的地区就突然转变口味，除非你是喜欢泡椒食物的口感口味，否则所谓的“抵抗寒冷、驱除风湿、关节炎和感冒”对于现代人几乎没有意义，反而会让你的肠胃不适应，出现“上火”的症状。可以多吃些以前常吃的食物，适量多品种的吃些当地特色食物和风味小吃，逐步适应。
6.喝些茶叶蜂蜜水
有过敏体质的同学除了找出过敏源，在医生指导下进行脱敏治疗外，如果出现轻微的荨麻疹症状，可以多泡些茶叶蜂蜜水喝，既可以补充缺乏的微量元素，还可以补血加快血液循环，促进致敏物质的排出，减轻过敏症状
7.多喝酸奶
常见的酸奶还有4种益生菌，可以促进肠道菌群的调节，以缓解胃肠道不适。但注意不要大量饮用冷藏后的酸奶，以免加重腹泻。
8.适当服药
如果胃口不好、消化不良，可以服用酵母片、山楂丸、保和丸等帮助消化，促进食欲。如果呕吐、腹泻可以服用黄连素、胃复安等，皮肤瘙痒可以服用开瑞坦。当然，最好还是去找校医院的大夫看病，不过。藿香正气类药虽然好，但主要适用于胃肠型感冒，一定要知道藿香正气并不是万能的。
9.配合学校卫生工作
首先入学时请认真参加学校组织的体检，详实填写病历和病史记录，将既往病史填写清楚，并注意按期预防接种，保管好病历本。新生入校第一件事情就是彻底打扫寝室，这不但是从卫生角度考虑，也是对自我管理的一种锻炼。特别注意及时倾倒垃圾，不要讲吃剩的一次性餐具堆在寝室中。一旦生病了应及时就医，个人建议是先到校医院看病，如果病情没有好转，经济条件又允许可以遵医生的建议自费买一些比较好的药物服用
其实这是因为一个人长期的生活在一个比较固定的地区，呆了很长一段时间，已经完全适应了那里的环境，然后突然换到一个新的地方就不能够适应，这也就是大家经常说的水土不服。有些轻微的可能就会特别的不舒服，总觉得浑身不得劲儿，可是有一些比较严重的可能会拉肚子，吃不好睡不好，产生焦虑感。
其实我们从自己熟悉的地方到一个陌生的地方去，由于地域的一个变化，还有饮食习惯，空气质量，水质等等都会发生一定的改变，那么我们的身体刚刚到这个地方的时候，肯定是会有一个适应过程的，而每一个人适应的能力又是不一样的。如果说你的适应能力比较强的话，那么可能一两天你就能够接受了，但是如果说你的能力比较差的话，可能就需要一段的时间，而且这段时间里面你可能会厌食，精神不振，拉肚子这些状况发生。
千万不要觉得是因为当地的一个东西不干净或者怎么样，这仅仅是因为你的肠道和你的身体受不了其他地方的一些环境因素而已。建议我们刚刚到一个陌生的地方的时候，前面几天最好是不要喝当地的水，特别是那些没有经过卫生处理的水，我们可以先去喝一下矿泉水，等你的身体慢慢的习惯之后，再开始饮用当地的水。
其实要你习惯这个地方是需要一个过程的，不是说一天两天就能够解决的，可能一个星期也可能一个月。如果说我们要长期的待在这里的话，那么肯定要给自己一个适应的过程。也不要随便的半途而废，因为你不可能永远都待在一个地方吧，就算是不出差，也会想要去旅游，或者是有其他的一些事情去到外地吧。
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