【法律分析】
1、单病种报销一般是限额报销，即社保机构认定该病种的治疗费用为某一个固定金额，不涉及到其中费用核算等。简而言之就是明确规定某一种疾病该花多少钱，从而既避免了医疗单位滥用医疗服务项目、重复项目和分解项目，防止医院小病大治，又保证了医疗服务质量。
2、非单病种的话就要依据当事人的起付线、具体花费金额等进行核算，以核算结果为准进行报销。
【法律依据】
《中华人民共和国社会保险法》 第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
两者的区别在于计算报销金额的不同：
1、单病种报销一般是限额报销，即社保机构认定该病种的治疗费用为某一个固定金额，不涉及到其中费用核算等。简而言之就是明确规定某一种疾病该花多少钱，从而既避免了医疗单位滥用医疗服务项目、重复项目和分解项目，防止医院小病大治，又保证了医疗服务质量。
2、非单病种的话就要依据当事人的起付线、具体花费金额等进行核算，以核算结果为准进行报销。
扩展资料：
单病种付费
单病种付费是付费总额控制的一种方式，即患者确诊入院，签署单病种付费诊疗协议书后，按单病种价格一次性支付所定费用，由医院包干使用。住院期间各项诊疗费用如超出部分由医院承担。
如果患者主动要求入住优质病房，超出普通病房标准的部分，以及患者要求进行的不在该病种临床路径内明确的或与本病种无关的检查、治疗所发生的诊疗费用，均不计入单病种付费价格，由患者另行支付。
在实际治疗过程中，如果患者出现严重并发症等情况，经批准后退出临床路径，不再按单病种定价管理。试点医院近期将会把单病种付费价格等相关内容在医院醒目位置公示。
参考资料：百度百科-单病种医保医院
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