必须注意的事项包括：由于金属会对外加磁场产生干扰，患者进行核磁共振检查前，必须把身体上的金属物全部拿掉。不能佩戴如手表、金属项链、假牙、金属纽扣、金属避孕环等磁性物品进行核磁共振检查。此外，戴心脏起搏器，体内有顺磁性金属植入物，如金属夹、支架、钢板和螺钉等，都不能进行磁共振成像检查。进行上腹部（如肝、胰、肾、肾上腺等）磁共振检查时必须空腹，但检查前可饮足量水，有利于胃与肝、脾的界限更清晰。
目前的医学认为：由于核磁共振是磁场成像，没有放射性，所以对人体无害，是非常安全的。据了解，目前世界上既没有任何关于使用核磁共振检查引起危害的报道，也没有发现患者因进行核磁共振检查引起基因突变或染色体畸变发生率增高的现象。但是有10%的人会在磁共振封闭的空间内诱发幽闭空间恐惧综合症，会觉得有窒息感觉，呼吸急促的表现。
所有金属制品 磁共振设备周围（5米内），具有强大磁场，严禁病人和陪伴家属将所有铁磁性的物品及电子产品、各种磁性存储介质类物品靠近、带入检查室。最好也不要穿着有金属纽扣的衣服。还有衣服上的金属拉链、文胸上的金属搭钩都是隐患。钥匙、手表、假牙、硬币都不能带，体内有金属避孕环的也要注意。化浓妆 有些化妆品中含有某些金属，它们会与磁场发生反应。建议检查当天不要化妆，指甲油、止汗药、防晒霜、护发用的发蜡等也最好不要用。纹身、纹眼线 纹眼线、纹身中的颜料会加热，导致皮肤受到刺激甚至灼伤。检查中如果皮肤有刺激感，应立刻停止。
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