rna逆转录时65℃,5min是什么原理

rna逆转录时65℃,5min是什么原理,第1张

循环反应:1.变性,即对待扩增的RNA模板加热变性,温度条件89~95℃,保温定时间(5~120秒);2.复性,即RT引物(用于RT过程中,与RNA链结合并能引导CDNA合成的DNA寡核苷酸)与RNA链上的互补序列结合复性,温度条件55~68℃,保温一定时间(5~90秒);3.延伸,即逆转录酶催化RT引物延伸合成CDNA,形成RNA-DNA杂合双链,温度条件60~70℃,保温一定时间(60~180秒);杂合双链变性解链后,RT引物再结合到RNA链上,由逆转录酶第二次催化引物延伸合成CDNA,如此,利用RNA模板,可以反复进行CDNA合成,因而,称之为循环逆转录(Cycle Reverse Transcription,CRT)。

这个不同温度持续时间,以实际逆转录反应不同而有所差异。

RNA提取步骤及注意事项(仅供参考):

实验步骤如下:

1.取50—100mg的组织,加入1ml Trizol试剂,用匀浆器打匀(Trizol先放于冰上)。

2.将匀浆室温放置5min。

3.加入200μl氯仿,剧烈震荡混匀30s,冰上静置3min。

4.12000rpm,4℃离心15min。

5.将上清液小心转移到新的1.5ml离心管中(取400μl),加入等量体积的异丙醇,上下颠倒几次混匀,室温下放置15min。(此步中注意:不要吸取任何中间层物质,宁缺勿烂。)

6.12000rpm,4℃离心15min。

7.小心移去上清液,防止RNA沉淀丢失。

8.用70%乙醇(DEPC处理的水配制)洗涤1次,加入700μl乙醇,将RNA沉淀弹起,漂洗。(此时RNA是不溶解的)

9.8000rpm,室温离心10min。

10.尽可能彻底地吸走上清,防止RNA沉淀丢失。

11.真空离心干燥3—5分钟,或放在室温下使乙醇完全挥发掉。

12.沉淀用30μl DEPC-H2O溶解。如发现沉淀难溶,68℃处理10min。

13.RNA检测

(1)测定样品在260nm和280nm的吸光值按1OD=40μg/ml RNA计算RNA的产量。

OD260/OD280在1.8-2.0。

(2)进行甲醛变性琼脂糖凝胶电泳,确定RNA的完整性和污染情况。

注意事项:

1.获得RNA效率低有一下原因

a:样品裂解或匀浆处理不彻底

b:最后得到地RNA沉淀未完全溶解

2.A260/A280<1.65原因

a:检测吸光度时,RNA样品不是溶于TE,而是溶于水。低离子浓度和低PH条件下,A280值会较高

b:样品匀浆时加地试剂量太少

c:匀浆后样品未在室温放置2分钟

d:水相中混有有机相

e:最后得到地RNA沉淀未完全溶解

3.RNA降解原因

a:组织取出后没有马上处理或冷冻

b:样品或提取地RNA沉淀保存于-5--20度,未在-60--70度保存

c:细胞在胰酶处理时被破坏

d:溶液或离心管未经RBase去处理


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