医院科室设置齐全。临床科室主要有：心血管内科、消化 内科、血液内科、呼吸内科、肾病、内分泌科、神经 内科、神经外科、泌尿外科、 心胸外科、普通外科（胃肠科、肝胆科、肛肠科、急症科）、烧伤整形科、骨科、儿科、中 医科、化疗科、妇科、产科、眼科、耳鼻喉科、口腔科 、麻醉科、皮肤科、急诊科等。以上科室均设有门 诊。另外还开设了老干门诊、外宾门诊、性病、性不育门诊、小儿智力测试门诊、痔瘘门诊、心理咨询门诊、遗传咨询门诊、美容门诊、变态反应门诊 、方便门诊、专家专科门诊等特色专科门诊。
医技科室主要有：病理科、影像科、介入治疗科、特殊检查科、药剂科、输血科、检验科、核医学科、营养科、理疗科、手术室、内窥镜室、中心供应室等。
医院设有“二室、四所、八个中心”。即大同市肿瘤防治办公室，大同市临床心脏电生理室：大同市血液病研究所、大同市泌尿外科研究所、中日友好大同康仁尘肺研究所、大同市肿瘤研究所：大同市急救中心、大同市脑血管病研究中心、大同市防盲治盲中心、大同市医学美容研究中心、大同市医学影像检查中心、大同市内分泌疾病防治中心、 大同市器官移植中心、大同市血液净化中心。
医院配备有核磁共振、64排螺旋CT、螺旋CT、 ECT、C型臂血管数字减影仪、数字减影血管造影机、海德堡共焦激光系统、1300MAX机、彩色多普 勒、直线加速器、钴60肿瘤放疗机、人工心肺机、 血液层流病房、ICU、CCU配套监护设备、血液透析机、 前列腺射频治疗仪、全自动生化仪、德国百康生物共振过敏检测治疗仪等多种高、精、 尖设备，装备水平位居晋北第一。
医院心血管内科、血液内科、 呼吸内科、神经内科、神经外科、心胸外科、泌尿 外科、骨科、肿瘤科、皮肤科等均具有专长和优势 ，许多专业已跨入国家和省级先进行列。1991年以 来成功地开展了骨髓移植、肝移植、肾移植、复杂 颅脑手术、心脏直视手术、白血病MDR基因及微小 残留白血管的分子生物学研究、血浆交换和染色体 、射频导管消融术、经尿道前列腺电切术、人工髋 关节置换术、血液透析、介入放射、人工心脏起搏 器安置术、双肺大灌洗术等51项新技术项目。其中 ，经尿道前列腺电切术已逾1000例，居全省之冠，支气管镜的应用已达1500例，为全市之首，并率先在全省开展了支气管镜下治疗。省级以上杂志表学术论文837篇，获科技成果奖省级9项，市级20项。 98年医院投资120万元实行微机联网，现全院已实 现微机管理。98年3月我院加入因特网，开展远程会诊远程教学，并为学生提供了网上查询和网上教学的条件。
全国治疗肺间质纤维化最权威的专家是北京协和医院呼吸内科徐作军教授。这是徐教授的个人介绍：徐作军，男，主任医师，教授，医学博士，现为中国医学科学院北京协和医院呼吸内科博士生导师。中华医学会呼吸病分会间质病学组副组长。从事于呼吸内科医、教、研工作20余年，重点研究方向是有关肺间质纤维化、结节病、肺部感染和急性肺损伤等。
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