1、现代人工辅助生技术—试管婴儿，使精子失去了优胜劣汰竞争机会，可能将带微缺失的Y染色体遗传下去。容易造成流产死胎，先天畸形等缺陷。
2、如果女性身体不具备孕育条件，比如内分泌紊乱，黄体功能不全，有过流产史。即使施行试管婴儿手术成功，也可能造成流产。
3、可能出现伦理道德问题。地下精子库的不规范增加了人工授精的许多伦理问题。有些机构对精子没有严格把关，精子来源不明。无法保证胎儿质量。
4、成本效益高，即获得每一个后代的成本高：做一次人工受孕需要2～3万人民币，受孕率15﹪，多次的话，受孕率能提高至37%左右，甚至更高
5、对女性生理的干扰较大。刺激排卵导致卵巢反应低下，易出现于卵巢功能早衰，年轻女性于40岁以前闭经、卵巢不敏感综合征。卵巢过度刺激综合征：血液浓缩血容量减少、少尿、腹水、胸水、电解质紊乱、高凝状态、肝肾功能损害、血栓形成、成人呼吸窘迫综合征，甚至死亡，发生率为0.6﹪～14﹪。
6、通过人工受精制造的试管婴儿比自然受精得来的婴儿出生时罹患脑瘫的几率高3倍。
试管婴儿存在以下并发症：
卵巢过度刺激症：在取卵后约1周左右，有少许患者出现以下症状：在临床上会表现腹胀、腹水(甚至胸水)、卵巢增大、胃肠道不适、少尿等症状，一旦妊娠该症状会持续二个多月才逐渐消除，这种病人术后禁止使用HCG安胎，并要密切和医生联系。该现象多见于多囊卵巢患者以及一些对药物敏感的人，这种人有几十个卵泡同时发育。
多胎妊娠：为了提高妊娠成功率，医生移植的数目通常都大于一个，这就存在多胎妊娠的危险。也许患者希望多胎，但多胎妊娠会增加许多风险：如妊娠高血压综合症、流产、死产、早产和低体重儿等。
另外，多胎也会给父母带来经济上，体力上和情感上的负担，这些问题会抵消为人父母的快乐。治疗不育的目的是为了获得孩子，为了母婴健康，避免多胎，首先要减少移植胚胎的个数，通常不超过3个。如发生多胎可通过减胎技术将胚胎减少至1～2个。
试管婴儿的优势也非常明显，为以下情况的人群创造了条件，让他们有机会有了孩子：
1、严重输卵管疾病，如患盆腔炎导致输卵管堵塞、积水或输卵管结核而子宫内膜正常或异位妊娠术后输卵管堵塞。
2、子宫内膜异位症
3、免疫性不孕症，男方精液或女方宫颈粘液内存在抗精子抗体者
4、男性因素，即少精症、弱精症、畸精症
5、原因不明性不孕症
6、其它原因的不孕治疗无效者
7、有遗传性疾病需要做移植前诊断者
8、其它：如卵泡不破裂综合症等
试管婴儿常见的弊端包括：
1、药物过敏，部分女性由于体质原因，会对促排卵药物产生过敏反应，从而影响效果；
2、妊娠风险，在进行试管婴儿时，会在母体内放置多个胚胎，以保证成活率，很容易导致多胎妊娠情况的发生，同时还会给母体本身带来巨大压力；
3、而且我们都知道试管婴儿就是利用精子和卵子在体外结合，然后通过手术的方式植入母亲体内。在此过程中，很有可能导致宫外孕的发生；
4、如果女性身体不具备孕育条件，比如内分泌紊乱，黄体功能不全，有过流产史。即使施行试管婴儿手术成功，也可能造成流产。
5、成本效益高，即获得每一个后代的成本高：做一次人工受孕需要2～3万人民币，受孕率15﹪。多次的话，受孕率能提高至37%左右，甚至更高
6、对女性生理的干扰较大。刺激排卵导致卵巢反应低下，易出现于卵巢功能早衰，年轻女性于40岁以前闭经、卵巢不敏感综合征。卵巢过度刺激综合征：血液浓缩血容量减少、少尿、腹水、胸水、电解质紊乱、高凝状态、肝肾功能损害、血栓形成、成人呼吸窘迫综合征，甚至死亡。发生率为0.6﹪～14﹪。
7、通过人工受精制造的试管婴儿比自然受精得来的婴儿出生时罹患脑瘫的几率高3倍。
试管婴儿技术从1978年世界上第一例试管婴儿诞生到国内1988年第一例试管婴儿技术产生，目前为止已经经历了几十年的历史了，从大数据来看，试管婴儿的孩子和正常人的孩子是没有差别的，所以也不用太过担心.
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