1、部分性抗雄激素综合征，即阴茎对雄激素不敏感，患者体内睾酮水平正常，但第二性征异常，甚至可能有尿道下裂。
2、病变原发于睾丸的高促性腺激素性腺功能低下症，这时下丘脑和垂体正常，能发出强有力的指令，但睾丸有病，无法执行生产性激素和精子的命令。
3、低促性腺激素性腺功能低下症，这是因为下丘脑和垂体有病变，不能向下发出分泌睾酮指令。
4、特发性阴茎短小，原因至今不明。
目前对于成年男性来说，唯一有效的方法就是手术治疗了
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阴茎短小的病因有哪些？主要有1.促性腺激素分泌不足导致的性腺机能减退由于下丘脑垂体的功能异常导致促性腺激素分泌异常，从而导致睾丸分泌的睾酮水平低下，影响了阴茎的正常发育，如卡尔曼综合征
、脑发育异常等。
2.促性腺激素分泌过多导致的性腺机能减退这类患者的下丘脑及垂体分泌功能均正常，但睾丸对促性腺激素反应异常，导致分泌睾酮功能减弱，包括睾丸缺如、睾丸下降不全等。
3.睾酮减少可通过负反馈机制使促性腺激素分泌过多，如部分Klinefelter综合征患者，但多数Klinefelter综合征患者的阴茎发育是正常的。
4.原发性小阴茎这部分患者下丘脑-垂体-性腺轴激素分泌均正常，部分患者到了青春期阴茎可以增长。病因尚不清楚，可能是一过性睾酮分泌下降等原因，也有少部分患者可能由于雄激素受体异常引起。
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