都是医学院的附属医院，要说区别也就里面的各科室医生水平的差别，一个江西，一个南昌。
南昌大学第一附属医院创立于1939年,历经75年的发展，医院已经成为集医疗、教学、科研、预防保健于一体的省直综合性三级甲等医院，是江西省规模最大、科室最全、病人最多、病种最多、手术室最多的品牌医院，也是江西人民心中综合实力最强的省内医院。
南昌大学第二附属医院坐落于 “物华天宝、人杰地灵”的江南历史文化名城南昌, 与江南四大名楼滕王阁交相辉映，是南昌市的地标式建筑，始建于1927年，是江西省最早的综合性公立医院。
南昌大学第一附属医院创立于1939年,历经75年的发展，医院已经成为集医疗、教学、科研、预防保健于一体的省直综合性三级甲等医院，是目前江西省规模最大、科室最全、病人最多、病种最多、手术室最多的品牌医院。实际开放床位近3000张，2014年年门诊量231.85万人次，最高日门诊量10963人次，出院病人超过11.48万人次，手术超过5.14万台次，平均住院天数9.6天。全院共有46个临床、医技科室，拥有消化科、神经外科、心脏大血管外科、重症医学科、呼吸内科、烧伤科、疼痛科、急诊科等8个国家临床重点专科，国家级诊疗中心1个以及省级临床重点专科7个、省医学领先学科18个、省级诊疗中心5个。是卫生部批准的江西开展人体器官移植、试管婴儿技术的指定医院。卫生部临床路径试点医院、优质护理服务示范工程重点联系医院。省级学会22个专业委员会挂靠医院。
教学：医院与南昌大学第一临床医学院两块牌子一套人马，每年承担博士生、硕士生、本科生、成教生、进修生、留学生等各层次近4000余人的教学任务，获得全国教育系统先进单位称号。拥有临床医学一级学科科学学位和专业学位博士点各1个（均涵盖17个二级学科，16个三级学科），博士后科研流动站1个。2013年医院代表南昌大学组队参加全国大学生临床技能竞赛，实现了江西省参加此项大赛零的突破，荣获全国比赛二等奖。
科研：自改革开放以来，荣获国家发明奖3项、国家科技二等奖3项、中华医学科技奖2项，省科技进步一等奖2项，实现江西医疗界国家“863”计划主持项目、国家“十二五”重大专项、中华医学科技奖零的突破。近三年主持承担国家自然科学基金94项。拥有省级临床医学科学研究院1个，省级研究所7个，省级重点实验室3个，省级工程研究中心3个，省科技创新团队4个。
2014年获得国家自然基金46项，省科技进步奖二等奖、自然科学奖三等奖各一项。
人才：享受国务院特殊津贴人选29人，百千万人才工程国家级人选1人，百千万人才工程省部级人选15人，卫生部有突出贡献中青年专家5人，江西省突出贡献人才3人，井冈学者1人，“赣鄱英才555工程”人选22人，拥有11名全省卫生系统高层次学术技术带头人11名（全省共20名），江西省高校学科带头人32人，江西省高校骨干教师20人。在职职工中正高职称274人，博士159人。
信息化建设：全国电子病历试点医院，全国信息化建设先进单位，首批全国医院业务公开示范点。在省内率先建立了电子病历和医生工作站系统、手术和麻醉信息管理系统，并与国家疾控中心信息系统成功对接，成为全国实现传染病和死亡病例网络直报的三家试点医院之一。在门诊实施了身份证实名挂号、自助挂号与充值缴费、自助取报告、自助打印磁共振、CT片，方便患者就医；开通了网络视频门诊、门诊远程会诊、微信就诊平台、社区网络系统，医院信息系统与基层和社区连接，保证患者足不出县，也能享受到该院的优质医疗资源和服务。
基础建设：医院目前占地150亩，绿化面积42%。拥有内科、外科、肿瘤、感染、烧伤、门诊、医技等诊疗大楼。2011年11月，科研辅助综合楼（新外科大楼）正式搬迁交付使用。2012年10月，投资500万元的气动物流系统开始试运行。省重点民生工程—急诊创伤救治中心大楼于2013年11月投入使用。占地490亩、开放床位3200张的象湖新城院区正在规划设计中。
指令性任务和公益活动：医院每年开展大量义诊、健康教育、免费救治活动。先后落实8个县医院“万名医师支援农村卫生工程”、4个卫生院（服务站）帮扶，援疆、省专家服务团、省卫生人才服务团人员选派，南极科考保健，以及“非典”、甲型H1N1流感、结石患儿筛查、抗冰救灾、抗震救灾、抗洪救灾等大量应急医疗救治等指令性任务，急诊量占南昌市的三分之一强。
医院是“光明微笑”工程、儿童“两病”免费救治、“明天计划”、“关心工程”、“微笑列车”、江西革命老区基金会先心病免费救治定点医院，被授予“生命希望工程爱心医院”称号。和李嘉诚基金会共同创立了华东第一家贫困晚期癌症患者救助机构——宁养院。
文化：以“德高术精，福泽人民”为院训，是全国卫生系统先进集体、全国卫生系统思想政治工作先进单位、全国医院文化工作先进单位、全国百姓放心示范医院，为全国唯一一家拥有2名“白求恩奖章”获得者的医院，并涌现了全国先进工作者、全国五一劳动奖章获得者、全国优秀教师、全国“三八”红旗手等一大批先进个人。
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