1、科属不同
茼蒿： 茼蒿是双子叶植物纲桔梗目菊科春黄菊族茼蒿属植物。
芦蒿： 芦蒿是双子叶植物纲桔梗目蒿属植物。
2、别名不同
茼蒿：别名有同蒿，蓬蒿，蒿菜，菊花菜、塘蒿、蒿子杆、蒿子、蓬花菜、皇帝菜。
芦蒿：别名有蒌蒿、水蒿、柳叶蒿、驴蒿、藜蒿、香艾、小艾、水艾、蒿苔。
3、习性不同
茼蒿： 茼蒿对光照要求不严，一般以较弱光照为好。属短日照蔬菜。在长日照条件下，营养生长不能充分发展，很快进入生殖生长而开花结籽。
芦蒿：生育习性是耐湿、耐热、耐肥，但不耐旱，虽在种类土壤中均可生长，但以保水保肥性能好的沙质土壤最为适宜。
芦蒿和茼蒿的区别是：
1、别称区别：
芦蒿别称蒌蒿、水蒿、柳叶蒿、驴蒿、藜蒿、香艾、小艾、水艾；茼蒿别称同蒿，蓬蒿，蒿菜，菊花菜、塘蒿、蒿子杆、蒿子、蓬花菜、皇帝菜。
2、形态区别：
芦蒿是多年生草本植物；植株具清香气味。主根不明显或稍明显，具多数侧根与纤维状须根；很状茎稍粗，直立或斜向上，直径4-10毫米，有匍匐地下茎。
茎少数或单，高60-150厘米，初时绿褐色，后为紫红色，无毛，有明显纵棱，下部通常半木质化，上部有着生头状花序的分枝，枝长6-10（－12）厘米，稀更长，斜向上。
茼蒿光滑无毛或几光滑无毛。茎高达70厘米，不分枝或自中上部分枝。基生叶花期枯萎，头状花序单生茎顶或少数生茎枝顶端，但并不形成明显的伞房花序，花梗长15-20厘米。总苞径1.5-3厘米，总苞片4层，内层长1厘米，顶端膜质扩大成附片状。舌片长1.5-2.5厘米。
3、地理分布区别：
茼蒿原产地中海，在中国已有900余年的栽培历史，且分布广泛，但南北各地栽培面积很小。分布在安徽、福建、广东、广西、广州、海南、河北石家庄、湖北、湖南、吉林、山东、江苏等省。
芦蒿多生于低海拔地区的河湖岸边与沼泽地带，在沼泽化草甸地区常形成小区域植物群落的优势种与主要伴生种；可葶立水中生长，也见于湿润的疏林中、山坡、路旁、荒地等。
芦蒿和茼蒿的区别：
一、外观不同，虽然芦蒿和茼蒿均属于菊科植物，但是茼蒿茎部为绿色，叶子颜色偏绿部分偏黄，而芦蒿颜色偏青色，长相也是不同的，仔细辨认有很明显的区别。而且两者气味也不同，芦蒿带有淡淡的清香，而茼蒿是一种特殊的香味。
二、食用方面有区别。芦蒿食用时一般选取的是茎部，而茼蒿在食用时和一般的蔬菜没有什么区别，基本上除了根部，整体都是可食用的。
地理分布
多生于低海拔地区的河湖岸边与沼泽地带，在沼泽化草甸地区常形成小区域植物群落的优势种与主要伴生种；可葶立水中生长，也见于湿润的疏林中、山坡、路旁、荒地等。
产中国黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古（南部）、河北、山西、陕西（南部）、甘肃（南部）、山东、江苏、安徽、江西、河南、湖北、湖南、广东（北部）、四川、云南及贵州等省区；蒙古、朝鲜及苏联（西伯利亚及远东地区）也有。模式标本采自西伯利亚东部色楞格斯克附近。
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