半合子是医学遗传学名词。
虽然具有二组相同的染色体组，但有一个或多个基因是单价的，没有与之相对应的等位基因，这种合子称为半合子。
举例说明：
例如果蝇雄体系由一对不同的XY性染色体所决定的，在雄果蝇中X染色体上的基因在细胞中只有一套，所以成半合状态。这时由于隐性基因的作用可以表现出来，所以具有一个白眼基因w的雌果蝇（w/+）是红眼，雄果蝇（w/Y）则是白眼。
含有这种基因座位的染色体部分发生缺失的染色体在发生交换重组后也同样呈半合状态，这时雌果蝇只带一个w基因而表现为白眼。
杂合突变和纯合突变，是基因突变的两种类型。纯合突变是指一对等位基因都存在突变。杂合突变指一对等位基因中，只有其中一个基因出现突变。比如等位基因aa突变成了AA就是纯合突变，突变成Aa就是杂合突变，所以纯合突变比杂合突变更为严重。
从遗传学的角度来说，第一代的突变个体就是纯合突变，属于比较严重的情况，而且可以稳定的遗传下去。说的那种病的意思是病人原有基因是杂合子，（如Aa），发生了突变（突变成了aa），所以表现出了治病性状。
相关信息
基因突变可以发生在发育的任何时期，通常发生在DNA复制时期，即细胞分裂间期，包括有丝分裂间期和减数分裂间期；同时基因突变和脱氧核糖核酸的复制、DNA损伤修复、癌变和衰老都有关系，基因突变也是生物进化的重要因素之一。
所以研究基因突变除了本身的理论意义以外还有广泛的生物学意义。基因突变为遗传学研究提供突变型，为育种工作提供素材，所以它还有科学研究和生产上的实际意义。在一定的条件下基因也可以从原来的存在形式突然改变成另一种新的存在形式，就是在一个位点上。
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