内分泌腺是没有导管的腺体，能产生激素直接分泌于血液中。对身体的代谢、生长、发育、生殖等机能起重要的调节作用。内分泌器官有脑垂体、甲状腺、甲状旁腺（上皮小体）、胸腺、肾上腺等。
犬的脑垂体较小，呈圆形，位于脑的底部，在垂体窝中，分为前叶和后叶。前叶又称腺垂体，分泌许多激素，如：促甲状腺激素、促肾上腺激素、促性腺激素等。后叶又称神经垂体，分泌加压素和催产素。脑垂体通过刺激和调节其他内分泌腺，影响机体生长、发育、新陈代谢和生殖活动。
犬的甲状腺位于气管前部，在第六、七气管环的两侧，腺体呈红褐色，包括两个侧叶和两叶之间的腺峡。甲状腺分泌甲状腺素和降钙素，具有调节代谢的功能。甲状腺素能促进蛋白质的合成、肝糖原的糖化、胆固醇的合成和胆汁酸的生成等，有提高基础代谢的作用。
甲状旁腺（上皮小体）是一对小腺体，似粟粒，位于甲状腺前端附近或包埋于甲状腺内。能分泌甲状旁腺激素，主要维持有机体内钙盐的正常代谢。
肾上腺有一对，两侧肾上腺的形态位置有所不同。右侧肾上腺略呈菱形，位于右背内缘前部与后腔静脉之间。左肾上腺稍大，为不正形梯形，前宽后窄，背腹侧扁平，位于左肾前端内侧与腹主动脉之间。肾上腺有皮质和髓质。皮质部呈黄褐色，分泌皮质激素，主要功能是调节机体代谢和维持生命。髓质部为深褐色，分泌肾上腺素，具有增强心血管系统的活动，抑制内脏平滑肌及促进糖代谢的机能。
犬的胸腺较小，结构似淋巴组织，分为左右两叶，外包一层薄而疏松的弹性纤维囊，位于胸腔内，在心脏前下部的纵隔腔内。犬出生后两周内，胸腺逐渐增大，2～3个月开始脂肪浸润，2～3岁以后萎缩。胸腺具有淋巴器官的作用，与抗体的形成有关。
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