1、干酪乳杆菌：除了保加利亚乳杆菌，嗜热链球菌，还含有干酪乳杆菌，可使制成酸奶中干酪乳杆菌成为优势菌群。作用：干酪乳杆菌具有抑制幽门螺旋杆菌在体内生长，有效地在减轻胃肠道的致病细菌性疾病。降低胆固醇水平，增强免疫反应，控制腹泻，缓解乳糖不耐症，抑制肠道致病菌等优秀的益生菌功能。由于干酪乳杆菌的pH值范围较宽，因此能更顺利地到达肠胃，发挥益生菌功效。
2、经典乳酸菌：它含有做酸奶的经典菌种--保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌。制成酸奶中保加利亚乳杆菌为优势菌群。作用：保加利亚乳杆菌可以增加IgA免疫蛋白分泌，维持肠道正常细菌生态，缓解便秘，抑制幽门螺旋杆菌在体内生长，治疗及预防胃十二指肠溃疡，分解乳糖。
3、乳双歧杆菌：除了保加利亚乳杆菌，嗜热链球菌，还含有人体重要的肠道益生菌乳双歧杆菌，可使制成酸奶中乳双歧杆菌成为优势菌群。作用：双岐杆菌作为益生菌在人体结肠部位存活并且发酵，使结肠充满游离的乳酸。这些乳酸可以阻断厌酸的腐败细菌带来的腐败过程。由于腐败过程可制造亲致癌肽，所以双歧杆菌可以用于治疗及预防结肠癌，这就是为什么双岐杆菌具有制造乳酸从而终结腐败细菌的生命的作用。
3、嗜酸乳杆菌：除了保加利亚乳杆菌，嗜热链球菌，还含有嗜酸乳杆菌，可使制成酸奶中嗜酸乳杆菌成为优势菌群。作用：嗜酸乳杆菌提高巨噬细胞和淋巴细胞的活力，从而提升机体免疫力，帮助消化，维持肠道酸碱平衡，抑制病原菌生长，维持肠道正常细菌生态.
植物乳杆菌：植物源乳酸菌更适合中国人消化系统的乳酸菌。可用于发酵豆花或酸奶。作用：植物乳杆菌主要用于传统食品发酵，是一种非常健康的微生物有机食品原料。在帮助消化的同时，它对缓解肠功能紊乱、肠炎有良好的效果。可预防豆类过敏。植物乳杆具有破坏病原菌，保存食物中的营养成份、维生素、抗氧化剂等作用。此外，它还能制造人体所需赖氨酸。
制作酸奶的时候，一般情况下用的是保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌进行发酵的，发酵的比例是以1∶1或1∶2的比例混合发酵，而且这两个菌种在发酵特征上具有一定的互补性。
一般情况下，对于酸奶的生产通常所使用的菌种为保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌。这两种菌类是人体肠道内的正常菌群，它们不仅能耐受胃酸及胆汁酸的作用，而且还能在肠道内定殖，而且对于人的身体有一定的保健价值。
如果发酵酸奶的话，这种混合菌的最佳发酵比例是1∶2，发酵温度41摄氏度，接种量3-5%。两菌混合发酵可有效弥补单纯嗜酸乳杆菌乳的风味不足，同时可以增强酸乳的适口性。同时，两菌之间存在某种共生关系，可以使得产酸能力增强，从而缩短发酵的时间。
做酸奶可以用双歧杆菌，乳酸链球菌，嗜热链球菌和保加利亚杆菌等。
做酸奶的方法如下：
1、准备鲜奶3盒，酸奶1杯。
2、用开水将容器烫一下，约1分钟，主要是灭菌
3、将纯牛奶倒入容器内。
4、再倒入酸奶（做引子）。
5、用勺子搅拌匀。
6、将盖好的容器放入酸奶机内，改好上盖。
7、接通电源，8-12小时后，酸奶自动做好。
8、刚发酵好的酸奶，可以立即食用，但经过冰箱冷藏，进行纯化24小时，口感更佳，香味纯正。
9、打开看看，酸奶凝固得象豆腐脑似的，就成功了。
10、加上应市的水果颗粒伴着吃，味道会更美。
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