南京明基医院为明基友达集团本着回馈社会、服务民众的精神，经国家卫生部批准投资设立的医院。医院依据国家三级综合医院标准建立，占地600亩。工程分三期，其中一期投资16亿元人民币，主要以开展普通医疗与特需医疗服务为目标，建成1,500床；二、三期将增加科研实验、临床教学及健康促进等医疗项目，将发展至3,000床规模。
医院设有内、外、妇、儿、中医、急诊等一级临床科室，配备检验、影像、病理、实验室等医技科室，高水平配置内镜中心、重症监护病房(ICU)、国际医疗中心、心脏中心、肿瘤放疗中心、血液净化中心、康复医学中心等，提供普通医疗、特需医疗、健康管理等综合医疗服务，开展医疗、康复、预防保健、科研、教学等医学活动。拥有众多台湾、海外及大陆医疗专家为民众提供优质的医疗服务。
在省市各项政策扶持下，依托集团强有力的支持、南京丰富的高校及医疗资源和地域优势，南京明基医院10年发展战略：以优质医疗服务为基础，以诚信为准则，以整合集成资源为手段，全面创建集医疗服务、生物科技研发、转化医学研究为一体的明基医疗中心BenQ Medical Center.
目前国内较好的医院有：1、中国人民解放军总医院：专业的内科、外科、心脏病科、呼吸科、血液病科、风湿免疫科等，拥有先进的诊疗设备，具有高水平的医疗团队，可以为患者提供全方位的诊疗服务。
2、北京协和医院：拥有一流的医疗设备，可以满足患者的各种需求，拥有专业的医护人员，可以为患者提供全面的诊疗服务。
3、上海交通大学医学院附属仁济医院和上海复旦大学附属华山医院：拥有一流的医疗设备，可以满足患者的各种需求，拥有专业的医护人员，可以为患者提供全面的诊疗服务，上海复旦大学附属华山医。
4、华中科技大学同济医学院附属同济医院：拥有一流的医疗设备，可以满足患者的各种需求，拥有专业的医护人员，可以为患者提供全面的诊疗服务。
5、北京大学人民医院：拥有一流的医疗设备，可以满足患者的各种需求，拥有专业的医护人员，可以为患者提供全面的诊疗服务。
综合性大学医学部，2所南京大学医学部 附属医院：鼓楼医院（三级甲等）
东南大学医学院（原铁道医学院） 附属医院：中大医院（三级甲等）
专业性医科大学，2所
南京医科大学 主要附属医院：江苏省人民医院（三级甲等）、南京医科大学附属第二医院（三级乙等）、江苏省肿瘤医院、南京市口腔医院、江苏省口腔医院、南京市脑科医院、南京市第一医院（三级甲等）、南京市儿童医院（三级甲等儿童医院）、江苏省妇幼保健医院
南京中医药大学 主要附属医院：江苏省中医院（三级甲等中医院）、江苏省第二中医院、南京市中医院（三级甲等中医院）
军队院校，1所
解放军第二军医大学南京军医学院（以培养军队医疗系统高级护理人员出名）
民办本三院校，2所
南京医科大学康达学院
南京中医药大学翰林学院
中国药科大学是药学类院校，没有医学类专业。
南京的医学类学校，在全国都只能算二流，要说实力谁弱谁强，无可比性，南医大应该是综合实力最强的，医学类学科门类全，附属医院多且医疗科研实力雄厚，但是南京大学医学部恐怕在基础医学和临床医学方面也不错。
而南京中医药大学则是中医学类院校，因为是国家中医药人才培养基地和留学生基地，因此在全国的影响力反而比南京医科大学大。
总的来说，学临床医学或基础医学，最佳是南医大和南大医学部，学中医，则是中医药大学，学药学，惟有中国药科大学！
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