二代测序就是一种技术,不过测序原理分几种,一种是illumina的边合成边测序原理,目前使用最多,还有就是life的h离子转换ph的测序方法。
现有的技术平台主要包括Roche/454 GS FLX、Illumina/Sol-exa GenomeAnalyzer、Helicos BioSciences公司的HeliScope™ Single Molecule Sequencer、美国Dana-her Motion公司推出的Polonator;
以及连接法测序 (sequencing by ligation),即通过引物来定位核酸信息,技术平台有Applied Biosystems/SOLiD™ system。
扩展资料:
第二代测序技术的背景:
1、DNA测序技术:
长期以来,DNA测序技术一直是分子生物学相关研究中最常用的技术手段之一,从一定程度上推动了该领域的快速发展。人类基因组计划、转录组分析、微生物基因组重测序、单核苷酸的多态性 (single nucleotide polymorphisms,SNP) 分析等方面也促进的其他生物学领域的研究和发展。
每一代测序技术的更替都标志着生物学中基因芯片、数据分析、表面化学、生物工程等技术领域有了新的突破,从而应用在了测序领域,大大降低了测序成本,提高了测序效率,使测序向着高通量、低成本、高安全性和商业化的方向发展
2、第一代DNA测序:
尽管第一代 DNA 测序技术以其可达 1000 bp 的测序读长、99.999% 的高准确性帮助人们完成了大量的测序工作,但其测试速度慢、成本高、通量低等方面的不足,也致使其不能得到大众化的应用。
随着科学技术的进步以及科研人员对测序技术的努力开发,2005 年 Roche 公司发布的 454 测序系统标志着测序技术跨人高通量并行测序的时代。
第二代 DNA 测序技术又称大量并行测序技术 (massive parallel sequencing,MPS)、高通量测序技术(high—throughput sequencing,HTS),以低成本、99% 以上的准确度,1次可对几百、几千个样本的几十万至几百万条 DNA 分子同时进行快速测序分析。
这一时期的代表技术有 Roche 公司的 454、Illumina公司的 Solexa、ABI公司的SOLID,由于该时期的测序技术十分前沿,因而市场主要被这三家公司所垄断
二代测序技术又称为高通过量测序技术,是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序,可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势,在生命科学领域已经被广泛应用。NGS又叫高通量测序,当传统的癌症治疗不起作用,或者医生不能确定患者的癌症起源(原发灶)时,NGS(二代测序)可以帮助确定肿瘤中的基因突变,这些突变可能与某些针对特定变异的药物相匹配。NGS主要优势是通量大,可以得到海量的数据,高通量最小的数据量单位是G,而一代测序一次只能产生1K的数据。
NGS对晚期癌症患者的用处有多大,有研究表明:
1、在80.5%的患者中发现了潜在的可操作的基因组变异;
2、在接受测序指导治疗的132名患者中,37.1%的患者取得了临床获益,19.7%的患者获得了超级应答(定义为将他们的疾病控制至少一年);
3、对于原发灶不明癌患者,在近一半(50.9%)的病例中,NGS解决了组织溯源问题,为医生提供更好的线索,了解哪些标准疗法和靶向疗法可能会有所帮助;
4、在15.8%的癌症患者中发现了潜在的可遗传胚系致病变异(增加患癌风险),其中4.8%与靶向治疗相关。
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