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从学科建设来看，温州医科大学拥有两个b学科和六个c学科，在医学学科发展方面取得了一定成绩。拥有12个一级学科硕士点、2个博士后流动站和多个省级重点建设学科。根据ESI全国高校综合排名，温州医科大学拥有临床医学、免疫学等八个学科，进入前1%。
从人才培养质量来看，温州医科大学拥有本科生、硕士、博士、博士后的全方位、多层次人才培养体系。据该校统计，其临床医学毕业生参加全国医师资格考试的合格率一直位居全国前10%。是浙江省重要的优秀医学人才培养基地，毕业生素质逐年提高。
从师资队伍来看，温州医科大学现有教职工14000余人，其中具有高级职称的1800余人。学校总部有近1700名全职教师，1200多名拥有博士学位的教师。为了提高教学水平，温州医科大学聘请了一批国家级人才，包括中国工程院院士、全国优秀青年、全国优秀教师等。
在医疗实力方面，温州医科大学附属眼科医院连续三年位居全国眼科医院第一，眼科稳步位居全国第二。三所附属医院已进入2020年中国医院科技价值评估榜单前100名，是一所高水平的医科大学。
从学校排名来看，温州医科大学在2022年校友会医科大学排名第16位，在全国高校排名第129位。是一所综合实力较强的医科大学。
根据毕业生就业质量报告，温州医科大学2020年毕业生整体就业率为96.33%，其中硕士、博士生就业率为98.84%，大学毕业生就业率为95.36%，学校就业形势良好。
然而，医学专业的就业门槛通常相对较高。本科生主要集中在进修，很少有毕业生毕业后直接工作。2020名本科毕业生中有41.49%选择进入研究生院。
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