两种方法的试剂和仪器价格有较大差异，主要是因为原料价格和用量不同、仪器检测原理不同。目前的碳13呼气试验基于红外吸收光谱技术进行样品测量，为保证临床准确性，需要服用较大剂量的碳13尿素和使用比较昂贵的仪器。实际上，该测量技术也是近几年才比较成熟，较早期的碳13呼气试验需要使用更昂贵的质谱仪才能进行准确测量。相反，碳14呼气试验采用的核测量技术比较灵敏，受检者仅需服用及其微量的碳14尿素，仪器设计和制造成本也更低。对了可以统一知道看下的
主要区别在于碳13元素稳定性更好，无辐射作用。碳13是碳元素的一种同位素，它的原子核内含有六个质子和七个中子。碳14也是碳元素的一种同位素，它的原子核内含有六个质子和八个中子，它的中子数比碳13多一个，因此碳13的稳定性要比炭14高，碳14有一定的放射性而碳13没有。
因此对于儿童、孕妇、年老体弱者如果要测定幽门螺杆菌行呼气试验，建议行碳13呼气试验，因其无创伤、无放射性、准确性高，有利于儿童、孕妇、年老体弱者使用。
全世界人群总幽门螺旋杆菌的感染率在59.2％左右。幽门螺旋杆菌感染与胃溃疡、胃癌有一定的关联性。碳13呼气试验和碳14呼气试验是一种无创的检查幽门螺旋杆菌感染的方法。
碳13呼气试验和碳14呼气试验检测胃内幽门螺旋杆菌感染的原理是相同的，都是利用幽门螺旋杆菌产生的尿素酶对口服的尿素进行分解为碳13或碳14标记的二氧化碳。
然后通过特定的仪器检测呼气中碳元素的相互作用活性度，彼此的区别为碳13元素稳定性更好，无辐射作用，碳13呼气试验可适用于儿童和孕妇的幽门螺旋杆菌检测，碳14呼气性试验价格便宜，但碳14元素有辐射，因此碳14呼气试验不建议应用于14岁以下儿童和孕妇的幽门螺旋杆菌感染检测。
综述对于正常人来说，碳13呼气试验和碳14呼气试验区别不大。
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