两种方法的试剂和仪器价格有较大差异，主要是因为原料价格和用量不同、仪器检测原理不同。目前的碳13呼气试验基于红外吸收光谱技术进行样品测量，为保证临床准确性，需要服用较大剂量的碳13尿素和使用比较昂贵的仪器。实际上，该测量技术也是近几年才比较成熟，较早期的碳13呼气试验需要使用更昂贵的质谱仪才能进行准确测量。相反，碳14呼气试验采用的核测量技术比较灵敏，受检者仅需服用及其微量的碳14尿素，仪器设计和制造成本也更低。对了可以统一知道看下的
区别：1、试剂活性成份不同：尿素碳14呼气试验使用碳14标记的尿素，尿素碳13呼气试验使用碳13标记的尿素。
2、仪器检测原理不同：碳14是通过检测样本中是否含有14CO2释放的β射线来判断是否感染幽门螺杆菌；碳13是利用13CO2和12CO2红外光谱吸收峰位置的微小差异，通过检测样本中13CO2同位素丰度相对于13CO2天然丰度的变化量判断是否感染幽门螺杆菌。
3、样本采集方法不同：碳14呼气试验只需收集受检者服药之后的呼气样本进行测量，碳13呼气试验需要收集受检者服药前和服药后的两个呼气样本进行对比测量。
优劣：
1 碳14价格低廉
2 碳14放射性强一些，孕妇小孩不能检测。碳13没有此要求，安全稳定。
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