消化管(除口腔与咽外)自内向外均分为粘膜、粘膜下层、肌层与外膜四层
(一)粘膜
粘膜(tunicamucosa)由上皮、固有层和粘膜肌组成，是消化管各段结构差异最大、功能最重要的部分。
1.上皮上皮的类型依部位而异。消化管的两端(口腔、咽、食管及肛门)为复层扁平上皮，以保护功能为主其余部分均为单层柱状上皮，以消化吸收功能为主。上皮与管壁内的腺体相连。
2.固有层固有层(laminapropria)为疏松结缔组织，含细胞和纤维较多，并有丰富的血管和淋巴管。胃肠固有层内还富含腺体或淋巴组织。
3.粘膜肌层粘膜肌层(muscularismucosa)为薄层平滑肌，其收缩可使粘膜活动，促进固有层内的腺体分泌物排出和血液运行，利于物质吸收。
(二)粘膜下层
粘膜下层(telasubmucosa)由疏松结缔组织组成，内含较大的血管与淋巴管。在食管及十二指肠的粘膜下层内分别有食管腺与十二指肠膜。粘膜下层中还有粘膜下神经丛，由多极神经元与无髓神经纤维构成，可调节粘膜肌的收缩和腺体的分泌。在食管、胃和小肠等部位的粘膜与粘膜下层共同向管腔内突起，形成皱襞(plica)。
(三)肌层
除食管上段与肛门处的肌层(tunicamuscularis)为骨骼肌外，其余大部均为平滑肌。肌层一般分为内环行、外纵行两层，其间有肌间神经丛，结构与粘膜下神经丛相似，可调节肌层的运动。
(四)外膜
外膜(tunicaadventitia)由薄层结缔组织构成者称纤维膜(fibrosa)，主要分布于食管和大肠末段，与周围组织无明显界限。由薄层结缔组织与间皮共同构成者称浆膜(serosa)，见于腹膜内位的胃、大部分小肠与大肠，其表面光滑，利于胃肠活动。
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