
2)指定切割后的文件前缀名 data_
3)指定切割后的文件后缀名为数字 -d
4)指定切割后的文件后缀名数字的长度 -a 4,即位宽(10进制),这里长度可根据切割出来的文件有多少估算,到底拆分为几个文件,由总行数,和每个文件的行数决定,不用指定。
如果为-a 4文件的后缀数字从0000开始计算,依次为0001,0002,0003,0004
split -l 2 data.log -d -a 4 data_
将文件data.log进行拆分,每个文件2行,如果文件总共有7行,则分为data_0000,data_0001,data_0002,data_0003
(自己)常用的文本文件的行处理命令
示例文件:test.vcf
1、head -n 10 test.vcf
head : 默认是提取文件的前10行,-n 参数可以设定选择文件的前n行
2、tial -n 10 test.vcf
tail : 默认是提取文件的末尾10行, -n 参数可以设定选择文件末尾的n行
3、sed -n '10,20p' test.vcf
sed -n : 随意选择需要查看的行
sed命令是一个面向行处理的编辑器,可以和正则表达式配合使用,附上较全面的sed命令使用教程。
https://man.linuxde.net/sed
4、awk 截取行的指定长度字符串
less test.gz |awk '{if(NR%2==1){print}else{print substr($1,1,75)}}' | gzip -c >test.part.gz
说明:对test.gz文件指定行截取75bp,原来是150bp
5、对n行的第三列求和,求平均值
grep -v ‘#’ test.vcf |sed -n '20,35p' |awk -F '\t' '{sum+=$3n++}END{print sum,sum/n}'
(linux 一行命令计算速度比Python快,简单计算喜欢用linux命令)
记得随时整理使用过的命令,没学过linux,靠着各种帖子,随时需要随时补给,有点懒。
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