linux常用的批处理

基本语法：

for i in

do；

done

1、处理文件夹下的所有文件：

for i in $(ls /public/home/fengting/demo/pan69/sort_bam)

2、简单的for循环：

for ((i=1i<=33i++))

do  ngmlr -t 10 -r /public/home/fengting/database/reference/rice/IRGSP-1.0_genome.fasta -q /public/home/fengting/data/hhz/H7L$i.arrow.polish.fasta -o /public/home/fengting/data/rihhz/H7L$i.sam

分类: 电脑/网络 >>软件

解析:

将脚本添加到 /etc/rc.d/rc.local 中即可。这是由 Linux 启动时的第一个进程 init 控制的。init 进程还可以自动启动 /etc/rc、/etc/rc.d、/etc/rc?.d 目录下的许多脚本文件。

你可以在两条或者多条命令之间加上分号。比如，你想在/下创建一个文件夹，然后再给这个文件夹里面创建一个文件，在给这个文件一个777权限。就可以这么写：

mkdir

/testtouch

/test/1.txtchmod

777

/test/1.txt

还有就是管道符。管道符是连接几个命令的。管道符左边的命令是输出，管道符右边的命令式对左边输出的一个输入（有的时候可以理解为一个条件）

比如，有一个文件有100行（假设是/a.txt)，你只想查看第二十五行，就可以这么写：

head

-25

/a.txt

|

tail

-1

那么管道符的左边“head

-25

/a.txt"的意思是查看这个文件的前25行，

管道符的右边是查看倒数第一行，

那么这个命令连起来就可以理解为查看这个文件的前25行中的倒数第一行，也就是第二十五行。

---