求助：ncl在linux下的安装问题

CentOS6.4 安装NCL遇到的问题，有需要的朋友可以参考下。问题1：缺少openssl-0.9.8 结果程序报错："ncl: error while loading shared libraries: libcrypto.so.0.9.8: cannot open shared object file: No such file or directory"这是因为缺少共享库文件。解决方法：在/usr/lib下找到了 libcrypto.so.0.9.8k，做个链接。$ su$ cd /usr/lib$ ln -sf libcrypto.so.0.9.8k libcrypto.so.0.9.8如果无法获得超级用户权限，可以在home下建立个目录，如：/home/usr/lib$ cd /home/usr/lib$ ln -sf /usr/lib/libcrypto.so.0.9.8k ./libcrypto.so.0.9.8$ export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/usr/lib #或者是在.bashrc中添加这一行如果没找到合适版本的libcrypto，可以从这里下载：http://www.openssl.org然后$ ./config shared$ make将生成的 libcrypto.so.0.9.8 按照上面的方法 *** 作。再次运行NCL，报错内容变为 libssl.so.0.9.8，如法炮制。最后运行NCL，报错内容为：ncl: /home/usr/lib/libcrypto.so.0.9.8: no version information available (required by ncl)ncl: /home/usr/lib/libssl.so.0.9.8: no version information available (required by ncl)这个错误暂时没有方法解决，不过NCL可以运行，应该没啥问题。问题2：缺少libbz2.so.1.0 程序报错：“ncl: error while loading shared libraries: libbz2.so.1.0: cannot open shared object file: No such file or directory”解决方法：从http://sources.redhat.com/bzip2/下载安装包参考http://man.chinaunix.net/linux/lfs/htmlbook/chapter06/bzip2.html进行安装Bzip2 是块排序文件压缩器，比传统的gzip生成更高压缩比的文件。 安装下列程序: bunzip2 (link to bzip2), bzcat (link to bzip2), bzcmp, bzdiff, bzegrep, bzfgrep, bzgrep, bzip2, bzip2recover, bzless 和 bzmore安装下列库文件: libbz2.a, libbz2.so (link to libbz2.so.1.0), libbz2.so.1.0 (link to libbz2.so.1.0.2) 和 libbz2.so.1.0.2Bzip2 依赖于: Bash, Binutils, Coreutils, Diffutils, GCC, Glibc, Make. 安装 Bzip2 为编译 Bzip2 做准备 with:make -f Makefile-libbz2_somake clean-f标志使bzip2g根据另一个Makefile来编译，这里就是Makefile-libbz2_so文件，它创建一个动态的libbz2.so库文件，然后把bzip2工具连接到这个库上。编译软件包:make安装:make install把共享的bzip2二进制文件拷贝到/bin目录，创建必要的符号链接，作一些清理工作.cp bzip2-shared /bin/bzip2cp -a libbz2.so* /libln -s ../../lib/libbz2.so.1.0 /usr/lib/libbz2.sorm /usr/bin/{bunzip2,bzcat,bzip2}mv /usr/bin/{bzip2recover,bzless,bzmore} /binln -s bzip2 /bin/bunzip2ln -s bzip2 /bin/bzcat

下载好NCL，将软件包(.tar.gz文件)存放在 Cygwin目录\home\用户名\ 路径下。

双击桌面的“Cygwin”图标，然后。

$ mkdir /opt/NCL

建立一个目录

$ cd /opt/NCL

进入目录

$ tar zxf ~/ncl_ncarg-5.1.1.CYGWIN_NT-5.1_i686.tar.gz

解压

$ ls

你 可以看到bin include lib 三个目录

$ vi ~/.bashrc

在文件最末尾加入：

#NCL

export NCARG_ROOT=/opt/NCL

export PATH=$PATH:$NCARG_ROOT/bin

保存文 件，退出。

$ source ~/.bashrc

Linux下的安装过程和Cygwin下安装基本一致。

如果无法获得root权限，将NCL放在/home/ 路径下比较好。

下载好NCL，将软件包(.tar.gz文件)存放在 /home/用户名/ 路径下。

$ mkdir NCL

建立一个目录

$ cd NCL

进入目录

$ tar zxf ../ncl_ncarg-5.1.1.Linux_i686_gcc412.tar.gz

解压

$ ls

你可以看到bin include lib 三个目录

$ vi ~/.bashrc

在文件最末尾加入：

#NCL

export NCARG_ROOT=/home/用户名/NCL

export PATH=$PATH:$NCARG_ROOT/bin

保存文件，退出。

$ source ~/.bashrc

这样就完成了NCL的安装和设置。

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现在测试一下是否安装正确

$ cd ~/

$ mkdir temp

$ cd temp

建立临时目录，进入临时目录

$ ng4ex gsun01n

这条命令会复制gsun01n.ncl到当前目录，并运行 ncl <gsun01n.ncl

如果运行正常，会在X11窗口显示一张XY坐标图，单击鼠标进行图像切换。如果是在Cygwin下运行，需要先开启Cygwin/X server。

这个脚本测试完毕后，如果有兴趣，还可以测试gsunXXn，XX取值可以是01~11。

python很多库支持了对nc格式文件的读取，比如NetCDF4，PyNio(PyNio和PyNgl可以看做是NCL的Python版本)以及Xarray等等。

我最初使用PyNio，但是由于NCL到Python的移植并不完全，导致目前远不如直接使用NCL方便，而在接触Xarray库后，发现其功能强大远超NCL(也可能是我NCL太菜的原因)。

安装同其它库一致：

我这里以一套中国逐日最高温度格点资料(CN05.1)为例，其水平精度为0.5°X0.5°。

可以看到，文件的坐标有时间， 经度，纬度，变量有日最高温

我们将最高温数据取出

这与Linux系统中的ncl_filedump指令看到的信息是类似的

Xarray在读取坐标信息时，自动将时间坐标读取为了datetime64 格式，这对我们挑选目的时间十分方便。Xarray通常与pandas配合使用。

比如我们想选取1979.06.01-1979.06.20时期数据，我们只需

再比如我们想选取夏季数据时，只需

更多的时间 *** 作同python的datetime函数类似。

当我们想选取特定经纬度范围(高度)的数据时，.loc[]函数同样可以解决。

在这里，我选取了40°N-55°N，115°E-135°E范围的数据

甚至，我们还可以套娃，同时叠加时间和范围的选取

这足够满足常用到的数据索引要求。

对于这类简单排列的.txt文件，可以通过np.load读取，用pandas的.read_csv更为方便

读取txt的同时，对每列赋予了一个列名，通过data.a可以直接按列名调用相应数据。

对于较复杂的.txt文件，仍可通过该函数读取

skiprows=5跳过了前5行的文件头，sep='\s+'定义了数据间隔为空格，这里用的是正则表达。

pd.read_csv函数有很多的参数，可以处理各种复杂情况下的文本文件读取。

grib文件可通过pygrib库读取

import pygrib

f = pygrib.open('xxx.grb')

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