
读取NIFTI,使用自带的niftiread函数
filename = 'test.nii.gz'
img = niftiread(filename)
这样读取出来的只有一个数组,也就说只是单纯读了一个图像。另一种方法是使用matlab官方给出的一个工具包,不过我没有试过。
如果想读取其他信息:
info = niftiinfo('test.nii.gz')
结果是一个结构体:
需要得到拿个信息只需要按照查看结构体的方法就可以了。
读取dicom只读一张图片很简单,
img_path = 'test'%有没有扩展名dcm其实都可以
img = dicomread(img_path)
同样这样读出来的也只有一个数组,表示的是图像本身,如果想查看其他信息,可以使用dicominfo函数
img_info = dicominfo(img_path)
dicominfo返回的是一个结构体,其中包含了非常多的信息,其中一部分:
更多的时候需要读一个文件夹内的所有dicom图片,比如动态成像中不同的时间帧,或者三维成像中不同的切片,转化成.nii格式或者mat文件用作后续处理。
读取所有dicom图片的方法和读取普通图片其实是差不多的,就是先把所有文件名存成一个list,然后一个一个读,存到一个多维的数组中。
需要根据时间删除这个目录下的文件,/home/lifeccp/dicom/studies,清理掉20天之前的无效数据。
可以使用下面一条命令去完成:
1find /home/lifeccp/dicom/studies -mtime +21 -name "*.*" -exec rm -Rf {} \
这个是根据时间删除。
下面简要解释一下,这句shell命令:
1find /home/lifeccp/dicom/studies -mtime +21 -name "*.*" -exec rm -Rf {} \
/home/lifeccp/dicom/studies :准备要进行清理的任意目录
-mtime:标准语句写法
+10:查找10天前的文件,这里用数字代表天数,+30表示查找30天前的文件
"*.*":希望查找的数据类型,"*.jpg"表示查找扩展名为jpg的所有文件,"*"表示查找所有文件
-exec:固定写法
rm -rf:强制删除文件,包括目录
{} \:固定写法,一对大括号+空格+/+
当然也可以根据文件名、根据大小,根据其他不同条件过滤删除,或者修改等,可以考虑sort等命令结合使用。
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