lammps生成的文件怎么导入vmd

用materials studio建模转化成lammps data文件，我是用lammps里的msi2lmp工具转化的。

那个msi2lmp工具，手册第七章里面也有介绍，下载的lammps文件，tool目录下也有源代码和例子，你可以做相应的参考。

使用MS将PDB导出成car，mdf格式。

有关msi2lmp工具的使用(执行msi2lmp.exe 的权限 更改文件的使用权限):

按照以下顺序来的：

1，直接把msi2lmp.exe拷贝到指定文件夹下；

2，在ms中建立好结构模型后，在ds模块或者forcite模块中指定力场类型，如对xxx结构指定为cvff力场，export结构保存为.car格式，同时自动有.mdf格式的文件生成；

3，将xxx.car和xxx.mdf文件拷贝到msi2lmp.exe所在的文件夹，并将tools/msi2lmp/biosym_frc_files文件中对应的力场文件拷贝到这个文件夹中（如上面的cvff.frc）；

4，在这个文件目录下，通过终端命令行./msi2lmp.exe xxx -class I -frc cvff >data.xxx 运行程序，运行成功生成data.xxx文件和xxx.lammps05文件，data.xxx是空的可以直接删除，数据在xxx.lammps05文件中。

是。

1、用vmd处理lammpstrj文件时，用了dynamicbonds依旧跨边界现象严重的解决方法是使用命令。

2、lammps和vmd是有区别的，lammps是文件而vmd是处理文件的程序，是不同的使用性质。

1、首先，进入bios设置，方法为按住键盘上的【f2 】，再按【电源键 】开机。需要注意的是不同华硕主板，热键是不相同的。进入bios设置后，按键盘上的【f7 】，或点击右下方的【advanced mode (高级模式) 】；

2、选择【advanced (高级) 】后，再点击【vmd setup menu (vmd设置菜单) 】；

3、选择【enable vmd controller (启用vmd控制器) 】，然后选择【disabled (关闭) 】；

4、这时候会d出 warning (警告)，直接忽略，点击【ok 】，即可关闭【intel volume management device (vmd) 】技术；

5、最后，按键盘上的【f10 】，保存设置并离开。在save &reset窗口，直接点击【ok 】，计算机将会重新启动；

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