食管疾病：胃食管反流、反流性食管炎、食管息肉、食管癌、食道狭窄、是个静脉曲张、食管贲门失弛缓症等。
胃、十二指肠疾病：急性胃炎、慢性浅表性胃炎、慢性萎缩性胃炎、幽门螺杆菌感染、胆汁反流性胃炎、胃息肉、胃间质瘤、门脉高压性胃病、消化性溃疡、胃癌、胃肠功能紊乱、十二指肠癌等。
小肠疾病：急性肠炎、小肠良性肿瘤、小肠腺癌、感染性肠炎、小肠出血、肠结核、急性出血性坏死性肠炎、克罗恩病等。
结肠疾病：克隆恩病、细菌性痢疾、溃疡性结直肠炎、菌群失调相关性腹泻、肠结核、大肠息肉、功能性便秘、大肠黑变病、先天性巨结肠、肠道寄生虫病、肠易激综合征、结直肠癌等。
肝脏疾病：病毒性肝炎、药物性肝病、脂肪肝、酒精性肝病、自身免疫性肝病、肝硬化、肝性脑病、布加综合症、肝豆状核变性、肝寄生虫病、肝脓肿、原发性肝癌等。
胆道疾病：胆石症、急性胆囊炎、急性梗阻化脓性胆管炎、先天性肝内胆管扩张症、胆道蛔虫症、胆囊癌、胆管癌等。
胰腺疾病：急性胰腺炎、胰腺囊肿、慢性胰腺炎和胰腺癌。
腹膜、肠系膜疾病：急性细菌性腹膜炎、结核性腹膜炎、自发性腹膜炎、癌性腹水、肠系膜淋巴结结核、腹膜转移癌等。
消化系统常见疾病有1、食管疾病：常见疾病有食管炎、食管癌、食管贲门失弛缓症。
2、胃、十二指肠疾病：常见病种有胃炎、消化性溃疡、胃癌、十二指肠炎。胃神经宫能症等。
3、小肠疾病：常见病种有急性肠炎、肠结核、吸收不良综合症、急性出血性坏死性肠炎、克隆病等。
4、结肠疾病：各种痢疾、结肠炎、肠激惹综合征、结肠癌等。
5、肝脏疾病：肝炎、肝硬化、肝寄生虫病、肝脓肿、原发性肝癌等。
6、胆道疾病：胆石症、胆囊炎、胆管炎、胆道蛔虫症等。
7、胰腺疾病：急、慢性胰腺炎和胰腺癌。
8、腹膜、肠系膜疾病：急、慢性腹膜炎、肠系膜淋巴结结核、腹膜转移癌等。
胃食管反流病的病发是由于食管清除作用减弱、食管黏膜屏障缺损、反流屏障缺陷等多种因素导致消化道出现障碍引起胃食管反流，引起反流的原因主要有：第一，胃黏膜屏障缺损，这是因为患者有长期吸烟、酗酒等坏习惯导致胃食管黏膜受损、屏障作用下降，使黏膜易于受到反流物的损害引起胃食管反流病。
第二，食管的清除作用减弱，由于患者的食管蠕动和唾液产生异常导致反流物质不能够及时地清楚，降低其食管廓清反流胃内容物的能力引起胃食管反流病。
第三，反流屏障缺陷，由于患者有暴饮暴食或者是腹型肥胖的患者、有胃液分泌亢进的患者等等，因为食管下括约肌压力绝对或者是相对的降低，这样也会导致反流。
