中国莲系：大中花群：单瓣类：1、单瓣红莲组 2、单瓣粉莲组 3、单瓣白莲组
复瓣类：1、复瓣粉莲组
重瓣类：1、重瓣红莲组 2、重瓣粉莲组 3、重瓣白莲组 4、重瓣洒锦组
重台类：1、红台莲组
千瓣类：1、千瓣莲组
小花群，单瓣类：1、单瓣红碗莲组 2、单瓣粉碗莲组 3、单瓣白碗莲组
复瓣类：1、复瓣红碗莲组 2、复瓣粉碗莲组 3、复瓣白碗莲组
重瓣类：1、重瓣红碗莲组 2、重瓣粉碗莲组 3、重瓣白碗莲组。
美国莲系：大中花群
单瓣类: 1、单瓣黄莲组
中美杂种莲系 大中花群
单瓣类: 1、杂种单瓣红莲组 2、杂种单瓣粉莲组3、杂种单瓣黄莲组 4、杂种单瓣复色莲组
复瓣类: 1、杂种复瓣白莲组 2、杂种复瓣黄莲组
小花群单瓣类: 1、杂种单瓣黄碗莲组
复瓣类: 1、杂种复瓣白碗莲组
莲属有中国莲与美国莲2个种。中国莲多数植株高大，叶椭圆形，绿色，叶柄和花柄有倒刚刺。美国莲植株矮小，叶近圆形，深绿色，无倒刚刺，花单瓣黄色。中国莲分子莲、藕莲及观赏莲。中国荷花研究中心现保存品种301个，新品种碗莲98个，重台型31个，打破了红台莲一花独秀千年的局面。并蒂莲为瑞莲，赞美纯真的爱情。
观赏莲重瓣品种有：冰娇（黄）一丈青（粉白）、西湖红莲（深红）、红千叶（深红色，花瓣150枚以上）大洒锦（白色，边玫瑰紫，心瓣边缘玫瑰红斑）千瓣链（白色）、重台莲（黄白色）小桃红（初开瓣尖边微红，盛开白色）大碧莲（白色带绿晕）佛座莲（粉红色，花型似释迦牟尼佛像底座）碧降雪（白色，边带紫色条纹）并蒂莲（粉红色，双花背靠背开放）四季莲（深红色，4朵花向4个方向开）。单瓣有白孩莲（白色，花叶均小）。碗莲，花叶极小，叶直径约5～6厘米，花粉色或白色。
莲的品种分类，除分成子莲、花莲、藕莲外，花型可分单瓣、重瓣、半重瓣、重台、千瓣等5种，花色分为红、爪红（花瓣白色，瓣尖端红色）、白、黄、洒金、黄橙、红等6色；花径大小可分大（25厘米以上）、中（12～25厘米）、小（12厘米以下）3等，倪学明提出的分类是：
（一）子莲类
单瓣：单瓣红花子莲如湘莲；单瓣爪红花子莲，如白湘莲；单瓣白花子莲，如白花建莲。半重瓣：半重瓣红花子莲，如百叶莲。
（二）花莲类
单瓣：单瓣红花莲，如中国古代莲；单瓣爪红花莲，如红荷头；单瓣白花莲，如白君子小莲；单瓣黄红花莲，如舞妃莲。
半重瓣：红花莲，如红茶碗莲；爪红花莲，如锦边莲；白花莲，如白樱莲。
重瓣：红花莲，如红千叶；爪红莲，如寿星桃；白花莲，如白千叶；黄花莲，如黄白莲；洒金莲，如大洒锦。
重台：重台红花莲，如红苔莲。
千瓣：红花莲，如并蒂莲。
（三）藕莲类
单瓣：红花莲，如崖城藕；爪红花藕莲，如花香藕；白花藕莲，如大毛节；天花藕莲，如六月报。
名贵的品种有花托千叶，花蕊3色的衣钵莲，花托分裂为3，开3朵花的品字莲，一朵花5个心的五喜临门莲，一年四季开数次花的四季莲等。
