1、南京鼓楼医院
又是南京大学医学院附属鼓楼医院，创建于1892年，已经具有128年历史，目前为集医教研为一体的大型综合性三级甲等医院，也是全国较早的西医院之一。
2、江苏省人民医院，暨南京医科大学第一附属医院、江苏省临床医学研究院、江苏省红十字医院。江苏省妇幼保健院作为江苏省人民医院妇幼分院，实行一体化管理。
江苏省人民医院前身为1936年成立的江苏省立医政学院附设诊疗所。医院是江苏省属三级甲等综合性医院，担负着医疗、教学、科研、公益四项中心任务。
3、江苏省中医院（南京中医药大学附属医院）
创建于1954年10月，为全国首批成立的省级中医医院之一，首任院长叶橘泉为中科院学部委员。建院60多年来，
为适应社会需求，医院不断提高重危及疑难病症的诊治能力，加强中西医结合工作，综合实力显著增强，学术水平和诊疗能力不断提升，持续保持在全国中医系统的领先地位，现已成为全国著名具有浓厚文化底蕴的大型综合性三级甲等中医院。
南京医科大学附属明基医院
南京明基医院为明基友达集团本着回馈社会、服务民众的精神，经国家卫生部批准投资设立的医院。医院依据国家三级综合医院标准建立，占地600亩。工程分三期，其中一期投资16亿元人民币，主要以开展普通医疗与特需医疗服务为目标，建成1,500床；二、三期将增加科研实验、临床教学及健康促进等医疗项目，将发展至3,000床规模。
医院设有内、外、妇、儿、中医、急诊等一级临床科室，配备检验、影像、病理、实验室等医技科室，高水平配置内镜中心、重症监护病房(ICU)、国际医疗中心、心脏中心、肿瘤放疗中心、血液净化中心、康复医学中心等，提供普通医疗、特需医疗、健康管理等综合医疗服务，开展医疗、康复、预防保健、科研、教学等医学活动。拥有众多台湾、海外及大陆医疗专家为民众提供优质的医疗服务。
在省市各项政策扶持下，依托集团强有力的支持、南京丰富的高校及医疗资源和地域优势，南京明基医院10年发展战略：以优质医疗服务为基础，以诚信为准则，以整合集成资源为手段，全面创建集医疗服务、生物科技研发、转化医学研究为一体的明基医疗中心BenQ Medical Center.
