许多学者认为致畸、致突变、致癌三者间有一定关系，酰替苯胺类除草剂如敌稗等，经土壤微生物代谢，生产3，4-=氯苯胺；苯脲类除草剂敌草隆也可转变成3，4-=氯苯胺；而灭草隆则可形成4-氯苯胺。这些物质可被植物吸收，再进入生物系统。3，4-=氯苯胺在苯溶液中可转变成3，374，47一四氯偶氮苯，这些物质与已知致癌物质同属一组化合物。在农药的1500种活性成分中，约500多种有胚胎毒性，400多种可导致畸形。在胚胎发育过程中以器官形成期对农药致畸物最敏感，这一期是指受孕后的第15～60天，因为人体的几乎所有器官都在这期间形成。所以，胚胎在这一发育阶段受致畸物的作用后形成畸胎的几率最高。由于各个器官的发育时间不同，因而各器官受致畸物的作用而发生畸形的敏感期也不同。例如：受孕后的第21～40天心脏易受侵害，随后是四肢和眼，脑的敏感期很长，包括自受孕后第20天至分娩。生殖腺如睾丸和卵巢的敏感期也较长，自受孕后第45天至5个月，大部分器官在受孕60天之后对致畸物的敏感性明显降低。但由于小脑、大脑皮质及泌尿生殖系统仍在继续分化，因而即使是受孕60天后接触了农药，这部分器官仍可发生畸形。分娩后的哺乳期，有些农药的毒性成分可通过母乳输送给婴幼儿，使婴幼儿的生长发育受到影响。
农药的“三致”作用指的致畸、致突变和致癌。致畸是指农药干扰胚胎或胎儿的正常生长发育，造成器官形态结构的异常而形成畸胎或畸形儿的毒性。致突变是指农药损伤生物遗传物质造成不可逆诱变的作用。这种诱变如发生在体细胞则影响个体本身，如发生在生殖细胞则可遗传给下一代。致癌是指农药能引起人或动物发生恶性肿瘤的作用，可表现为发癌率增高、发癌时间缩短，或两者均有。
科学合理使用农药应当做到以下几点：
遵守农药安全使用规则：严格禁止剧毒、高毒、高残留或具有三致性（致癌、致畸、致突变）的农药在无公害农产品上使用。
遵守农药安全间隔期：安全间隔期是自喷药后到残留量降至最大允许残留量时所需要的时间。
安全防护措施：施用农药的人员必须做好安全防护措施，防止施药人员中毒。
减少用药：通过耕作措施，能消灭部分病虫，造成不利于病虫发生的条件，同时提高作物抗病虫的能力，从而减少用药。
