植物神经紊乱发病常与心理社会应激因素有关，部分也可能是由于遗传因素、性别因素和生物因素引起的。
基本病因
心理社会因素
长期的精神紧张、心理压力过大、以及生气和精神受到刺激等。
遗传因素
家族性自主神经失调症是一种少见的遗传性疾患，是自主神经系统先天性功能异常。该病为常染色体隐形遗传疾病，基因定位于第9号染色体长臂上异常。
性别因素
女性由于性腺的内分泌和某些生理过程等引起；男性多受酒精和烟草的影响。
生物因素
如脑部的感染、肿瘤、外伤、出血、中毒、营养代谢和精神活性物质等器质性病变，均可直接或间接地损害人脑的正常功能和结构，进而引发精神障碍
导致植物神经紊乱的原因有：
1、遗传因素，大多数植物神经功能紊乱病人都有家族性，但并不是该疾病都是遗传因素所致。
2、社会因素，各种引起情绪紧张的社会心理因素，都会成为该病的促发因素。工作压力大、学习负担过重、家庭纠纷、婚姻不幸、失恋、邻里关系紧张、同事或上下级关系不协调等等，都会使人神经过于紧张、心理负荷过重，而出现植物神经功能紊乱。
3、个性因素，植物神经功能紊乱，与个人性格也有很大关系。一般大多数病人有自卑、敏感、性格内向、情绪不稳定的特点，多表现为多愁善感、焦虑不安、不善与人沟通，遇事闷在心里，不能及时发泄情绪等等。
4、生物因素，身体其他部位病变，也可累及到中枢神经系统而引发精神障碍。
5、年龄因素，幼年时期由于儿童身体和精神发育并未成熟，所以缺乏自我控制情感和行为能力，同时因为其保持着幼稚情感行为和原始反射，所以对外界环境适应能力较差，再加上现在社会各方面对孩子压力增大，所以孩子会因各种心理因素影响而出现情感和行为方面障碍。
