根据发病过程，男性不育可以分为原发性不育和继发性不育两种。原发性不育是指男性从未使女性怀孕过，继发性不育是指男性可以使女性怀孕，不论最终的结果怎么样（如流产或死胎），但在以后由于疾病或某种因素影响了与生育有关的某个环节，以致夫妇连续同居 3 年以上、未使用避孕措施而妻子仍不能怀孕。
1、按不育病史分类：可分为原发性不育与继发性不育。前者指婚后从未有过生育，后者指曾有一次或几次生育，以后三年以上，没有采用避孕措施，仍未再有生育者
2、按治疗可能性分类：
可分为绝对性不育和相对性不育。无治疗成功希望的不育症称绝对性不育，有治疗成功希望的不育症称相对性不育
3、按病因性质分类：
可分为性不育和病理性不育、品质性不育和功能性不育、先开性不育和后天性不育
4、按引起不育的病因分类：
按可分为干扰不同的生殖环节性不育及精液检验的异常状态性不育。
归纳起来，男性不育按照大类可分为2大类：
1、原发性男性不育：指一个男子从未使一个女子受孕，不管这个女子是其妻子、性伴侣或其他等等。这实际上是依据患者的生育史进行判断的，它不同于特发性不育症的概念，更不是指不明原因的不育症，因而原发性男性不育不是病因诊断名词。对此易于混淆，应予鉴别。
2、继发性男性不育：指一个男子曾经使一个女子受孕，不管这个女子是否是他现在的配偶，也不管受孕的结果如何，而近12个月有不避孕性生活史而仍未受孕。总的来说，男性的继发性不育有较大的可能性恢复生育能力。因此，区分原发性不育与继发性不育是有临床实际意义的。
对于男性不育的这种疾病，很多人们由于受传统思想的控制，很少会愿意接受治疗的。其实这是一种很不对的表现，对于各种疾病，都应该做到在疾病出现症状的之后，早发现早诊断早治疗，不让疾病损害人体的健康。
WHO 提出了以病因诊断为依据的分类方法， 这一分类方法是目前世界上最为权威的男性不育症诊断分类方法，它把男性不育症分为16 类：
(1)性交和／或射精功能障碍
(2)免疫学病因
(3)原因不明
(4)单纯性精浆异常
(5)医源性病因
(6)全身性病因
(7)先天性异常
(8)后天获得性睾丸损伤
(9)精索静脉曲张
(10)男性副性腺感染
(11)内分泌病因
(12)特发性少精子症
(13)特发性弱精子症
(14)特发性畸形精子症
(15)梗阻性无精子症
(16)特发性无精子症
