发热一般是对于进入人体的异物包括病原微生物的一种清除反应。通常异物或病原微生物进到人体以后，人体会对病原微生物产生大量神经介质或炎性介质，炎性介质会随着血液流到全身。如果到达头部就会出现头疼、眼睛疼或后背疼、脖子疼、后颈部疼痛，这是由于炎性介质在脑部积聚。有人的发热不光是头疼，会出现四肢或关节酸疼，实际上是由于炎症介质引起的四肢和肌肉神经发生了病理性反应，出现疼痛的情况。
中医上认为发烧头疼跟太阳经里面有寒邪的收引有关系。中医讲，不通则痛，是因为太阳经的经脉由于受到寒冷刺激以后，经脉发生了痉挛或收缩，里面的精气运行不畅，只要不通就会出现疼痛。所以中医会用解表散寒，舒筋或活血药物治疗头痛等症状。
发烧是体表的温度上升（包括头）。但是身体里面却相应的降低。这样颅内压（俗称脑带里）升高所以才会感觉头重脚轻。
头疼的原因非常多，感冒发热、五官有毛病、血压异常、头部有障碍、贫血、便秘、煤气中毒、酒精中毒、神经疲劳等都会引起头疼。
头疼可能是脑膜受到了刺激，血管收缩使张力增加引起的，也可能是脑部提醒我们氧气不足，需要更多氧气的信号。只要含着许多氧气的血液流入到疼痛的地方，头疼就会立刻消失。不过必须找到头疼是什么原因造成的，才能解决头疼的问题
