因为这种药物是抑制排卵，并且扰乱了正常的内分泌，可能会月经紊乱，出现月经推迟。如果到了来月经的时间没有来，要到医院去做B超检查或者查血中的绒毛膜促性腺激素，如果确定没有怀孕，可以暂时观察。
由于药物造成的月经失调，一般一个月左右月经能够正常来，因为机体需要经过一段时间可以调理过来。
紧急避孕药由于其抑制、延迟排卵的作用和抑制子宫内膜的作用，可使下次月经延期，也可能由于临时用药造成的一次性血液中激素水平的暂时升高，下降后发生撤退性出血，表现为月经提前。服用紧急避孕药后大约有70%的妇女的月经会按期来潮，与其预期日期相差不到3天；月经提前的发生率（依服用的紧张避孕药种类不同可略有差别）一般在10-15%，有的人可提前7-10天。若月经延期，首先应注意排除妊娠，如果已超过下次月经日期一周，应做尿妊娠试验；如两周后仍未来月经，应去医院由医生决定是否需给予诱导月经的治疗。尽管紧急避孕药的剂量小、在体内存留的时间短、使用很安全，但毕竟会对排卵和子宫内膜有影响，短期内反复使用会增加月经紊乱的发生机率，而且与常规避孕药相比，其效果相对要差，避孕有效率仅为80%，而复方短效口服避孕药的效果可达99%以上。所以只是事后临时补救措施，不应当作常规避孕手段。
