医院现有妇产科、普通外科、 骨科、消化内科、血液内科、神经内科、心血管内科、泌尿外科、心胸外科、麻醉科、医学影像科、重症医学科、呼吸内科、医学检验科等省级临床重点专科14个，市级临床重点专科15个，国家临床药物试验验证专业9个，国家级内镜诊疗技术培训基地6个，是国家级博士后科研工作站，中南大学、吉林大学等重点院校医学博士、硕士研究生培训基地，全国优质护理服务示范工程卫生部重点联系单位。
苏北人民医院新区分院设有内科、外科、结核病科、肝病科、综合传染病科等临床科室。是“扬州大学医学院教学医院”；省卫生厅“耐多药肺结核定点救治医院”；现有结核病科、肝病科、感染病科、医学检验科、医学影像科等市临床医学重点专科5个。 内科 - 消化内科 - 血液内科 - 神经内科 - 心血管内科 - 呼吸内科 - 内分泌科 - 风湿免疫 - 肾脏内科 外科 - 普通外科 - 骨科 - 泌尿外科 - 胸心外科 - 神经外科 - 医学美容科 - 烧伤整形科 妇产科 - 生殖医学中心 儿科 - 新生儿科 急诊科
重症医学科 中医科 - 肛肠科 - 针灸推拿科 麻醉科
耳鼻喉科 肿瘤科 - 放射物理室 - 放疗技术室 眼科
皮肤科
老年医学科
口腔科
疼痛科
康复中心 医学影像科 - CT室 - MRI室 - 普通放射科 - 介入放射科 医学检验科
超声科
病理科
核医学科
功能检查科
药剂科
预防保健处
临床心理科 医学影像中心
肝胆胰中心
脑科中心
肿瘤诊治中心
脑卒中诊治中心 生殖医学中心 - 生殖医学实验室 - 男科 产前诊断中心
糖尿病诊治中心
血液净化中心
科室介绍的参考资料
扬州市三甲医院有四家，分别是扬州市第一人民医院、江苏省苏北人民医院、扬州市中医院、扬州市妇幼保健院，详情如下：
1、扬州市第一人民医院
医院地址在东关街道扬州市泰州路45号，设置有产科、肿瘤诊疗中心、血液净化治疗中心等。2005年10月，获得中央精神文明建设指导委员会授予的“第一批全国文明单位”荣誉称号。
2、江苏省苏北人民医院
江苏省苏北人民医院又名扬州大学医学院附属医院，成立于1900年，位于江苏省扬州市南通西路98号。医院现有妇产科、普通外科、[4]骨科、消化内科、血液内科、神经内科、心血管内科、泌尿外科、心胸外科、麻醉科、医学影像科、重症医学科、呼吸内科、医学检验科等科室。
3、扬州市中医院
扬州市中医院创建于1978年，综合性“国家三级甲等中医医院”。设有急诊、内、外、妇、儿、骨伤、针灸、介入、肿瘤等一级临床科室22个，心血管、消化、呼吸、肾病、血液、神经内科、神经外科、胸外、泌尿外科等二级专科33个，常年开放专科专病门诊45个。
4、扬州市妇幼保健院
扬州市妇幼保健院始建于1951年的苏北妇幼保健院，1982年在国庆路395号现址重建开诊，1996年与市妇幼保健所合署，市红十字医院、市计划生育指导所先后并入，2009年成为扬州大学医学院附属医院，2010年被省卫生厅确认为三级甲等妇幼保健院。
5、江苏省武警总队医院
地址位于：扬州市广陵区江都南路8号，人社部社保查询系统提示该医院为三级甲等综合医院。
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