常用抗乙肝病毒治疗药物有：干扰素、拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦等四种。各有利弊，需权衡制宜使用。进行药物治疗的原则有：A)病毒携带者，若肝功能正常不进行抗病毒治疗，若肝功能检查提示谷丙转氨酶为正常值两倍以上应进行抗病毒治疗B)注意因长期应用某个药物出现病毒变异而令药物失效的，注意整个疗程结束后的最初3个月每月监测一次肝功和乙肝病毒指标(HBeAg、HBVDNA)，此后延长监测时间。对于病情较重的肝硬化患者和疗效不好的患者，监测力度要加强，注意病情恶化对于疗效较好者可以每半年或一年检查一次。
1.急性肝炎的治疗
绝大多数急性肝炎不需要抗病毒治疗。急性病毒性肝炎一般具有自限过程，注意适当休息。症状较重，有黄疸者应卧床休息。给予清淡、富含营养且易消化吸收的饮食，注意蛋白质及维生素的摄入。恶心呕吐致影响进食、热量不足者应每日输液补充。根据病人不同征象采用相应的中药成方或辨证施治，对于缓解症状、缩短病程、减少并发症是有利的。但对于病程迁延超过8周，频繁复发者可考虑采用抗病毒疗法。一般多不主张应用肾上腺皮质激素，并避免应用对肝脏有损害的饮食和药物。
2.慢性肝炎的治疗
慢性肝炎一般病程较久，超过半年。在现有医学手段下，无法清除患者体内乙肝病毒。且这个疾病的服药时间漫长，因此首选强效、低耐药、安全性高的抗病毒药物，长期抑制病毒复制，延缓疾病向肝硬化、肝癌进展，提高患者生活质量。患者生活上动静结合，有规律饮食上适量进食优质高蛋白，适当补充维生素，微量元素，不宜过多吃糖及高脂肪的食物，要戒酒病配合医生给与必要的治疗：
临床上治疗乙肝的方法，根本上就是抗乙肝病毒治疗方法。目前有两大类治疗方法：1、口服核苷类似物疗法；2、注射干扰素类疗法。口服核苷类似物药物有六种：拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦、替比夫定、替诺福韦、丙酚替诺福韦，受到药物可及性和价格因素的影响，应用恩替卡韦治疗的乙肝患者最为广泛。随着丙酚替诺福韦的上市，它以高效抗病毒、副作用少、肝癌发生率低、至今保持零耐药而备受青睐。注射干扰素疗法分为普通干扰素和聚乙二醇干扰素，普通干扰素由于疗效低、副作用多而逐渐被淘汰。聚乙二醇干扰素尽管副作用多，但其疗程短、转阴率高仍被广泛采纳。
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