西医：上海二医大附属瑞金医院消化内科主任医师，吴云林，电话：021-64370045
生殖医学中心
瑞金医院生殖医学中心成立于2001年，是重点发展的一门新兴学科。在中心主任冯云教授带领下，在生殖医学中心医技护全体人员和研究生们的共同努力下，瑞金医院的生殖医学学科得以创建和发展， 并于2004年通过了国家卫生部评审，使我院获得开展人类辅助生育技术资质，成为上海市最早获得开展人类辅助生育技术的三家医院之一。经过五年多的运行，生殖中心已进入正常轨道，逐步发展壮大，形成了爱岗敬业、团结奉献的良好风气和工作作风，建立了完善的就诊流程、岗位责任制度、实验室质量监控制度和病案登记随访制度等一系列规范。由于出色、规范的运作，中心的临床妊娠率和种植率不断提高，稳居国内先进水平。
血液科
上海交通大学医学院附属瑞金医院血液学学科于70年代创建，在其奠基人—我国著名的血液学专家，国际肿瘤诱导分化治疗权威，中国工程院院士和法国科学院外籍院士王振义教授的推动下，于1987年，在瑞金医院、仁济医院、新华医院、第九人民医院血液科和二医大病理生理教研室的基础上成立了上海血液学研究所。第一任所长为王振义院士。
灼伤整形科
上海交通大学医学院附属瑞金医院灼伤整形科自1958年成功救治大面积烧伤钢铁工人邱财康以来，经过多年的探索，成功地创立以瑞金烧伤补液公式、混合移植方法、冬眠疗法等为特色的大面积烧伤救治方法，被誉为中国方法。
普外科
上海交通大学医学院附属瑞金医院外科是上海市重点学科、九.五和十.五期间211工程重点学科、上海市教委第二期重点建设学科、第一、二周期上海市医学领先专业重点学科、上海市医学重点学科，是外科硕士、博士培养点和博士后流动站。
神经内科
上海交通大学医学院附属瑞金医院神经内科已有近40年的历史，现分为2个病区、80张病床，共有医生25名，其中教授6人、副教授9人。拥有脑电图室、帕金森病诊疗与研究中心、上海阿尔茨海默病中心和神经病学研究所等。
内分泌代谢病科
上海交通大学医学院附属瑞金医院内分泌代谢病学科由邝安坤、陈家伦、许曼音教授等创建并引领，历经几代人传承，现已成为国内最重要的内分泌代谢病基地之一，与国际先进水平同步发展。
心血管内科
上海交通大学医学院附属瑞金医院心血管内科于1954年由我国著名心血管病专家陶清、龚兰生等著名教授创办，由戚文航、沈卫峰等教授继承发展，在国内外享有相当的知名度。1
消化内科
上海瑞金医院消化内科是国家211工程重点学科及国家教委重点学科组成单位，上海交通大学医学院重点学科，亦是上海市医学重点学科胃肠肿瘤的重要组成单位。
肾脏科
上海交通大学医学院附属瑞金医院肾脏专业始建于1965年，1976年成为一个独立的科室，现下设临床、病理、实验室及透析室4个部门，是国内成立最早、配置最完善的肾脏专科之一，并为上海市卫生局医学领先专业重点学科。
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