医院占地面积6.6万平方米，建筑总面积26万平方米，拥有临床科室79个，重症监护病区9个，开放床位3041张，医院员工5540人，其中专业技术人员3671人，高级职称382人，研究生以上学历868人，拥有一批在省内外具有较高影响力的医学专家和骨干。医院主要承担着鲁西南地区3000万人口繁重的医疗保健任务，2014年门诊量为222万人次，出院病人为13.6万人次，手术总量近8.6万例次。
医院不断开展技术攻关和创新，特色医疗项目优势明显。先后成功开展了山东省首例同位异体心脏移植手术、鲁西南首例肝脏移植手术、肾脏移植术、角膜移植术，完全自主成功开展自体造血干细胞移植技术。医院在心脑血管病的应急救治效率和成人康复诊疗水平处于鲁西南地区领先地位，心脏外科各类手术量年均1500余例，心脏内科介入术量年均6000余例。目前，医院已形成以心脏外科、心脏内科、神经内科、重症医学、神经外科、大骨科、血液科、内分泌科、乳甲外科、妇产科、生殖医学等为专长，以急危重症救治为特色的区域性综合性医疗中心。医院先后被国家卫计委、省卫计委评定为中国初级创伤救治培训基地、国家急性心肌梗塞救治项目山东培训基地、国家内镜与微创医学培训基地、国家级住院医师规范化培训基地、国家级心血管介入诊疗准入和培基地、国家临床药师培训基地、省级生殖医学中心、省级产前诊断中心、省级专科护士培训基地等。
医院坚持科技兴医的发展战略，着力构建特色学科群，以大学科为基础的学科发展方向基本形成。现有国家级临床重点专科1个，国家级中医药临床重点专科培育项目1个，省级重点学科和重点实验室5个，市级重点学科和重点实验室10个，校级重点学科、重点实验室、研究所（室）9个。
医院在研国家级科研基金22项，其中国家自然科学基金12项，在研省自然科学基金近80项，市级课题200余项，年发表国家级论文300余篇，SCI论文50余篇。医院积极加强国际交流与学术合作，与世界近20个国家和地区的世界知名医学院校及医院建立了友好合作、学术交流、人才培养等往来关系。与中国科学院、北京协和医院、中国解放军总医院等建立了技术协作关系，大大提高了医院的学术水平和技术进步。
医院坚持以病人为中心，以质量为核心，积极落实公立医院改革要求，紧紧围绕“质量、安全、服务、管理、绩效”的持续改进，不断强化内涵建设，全方位、创造性地推出了多项在全国拥有较大影响的管理改革。率先在全国实行单病种付费改革，在国内首次推出了临床路径管理的新模式（医师篇、护理篇、病友篇），进行了226个病种的临床路径管理工作。临床路径的实施大大规范了医疗行为、保证了医疗质量安全、降低医疗费用、切实保障了广大患者的健康权益。2014年，药品收入占业务收入的比例为28.4%，平均住院日8.5天。药占比已连续12年处于全国较优水平，年均接待来院参观学习的医院达200多家2000多人次。
目前，医院积极开展国际医院管理标准认证工作，紧紧围绕质量与安全主题，持续深化医院内涵建设，建立“以患者为中心，以质量与安全为核心”的诊疗模式，从管理体系、医疗服务、药物系统、院感监控、质量指标、员工资质、设施安全、医学教育等方面落实标准化与精细化管理，为患者提供了更加安全高效的人性化医疗服务，成效显著。省卫计委领导对我院积极探索并引入国际医院管理标准给予了高度认可，2014年市卫计委号召全市二级以上医院来我院学习标准化建设与精细化管理工作。
医院坚持政府指令性与公益性并重，全面做好社会公益事业。自2005年以来面向全国开展“爱心医疗救助工程”，每年免费救治100例特困家庭的先心病患儿，截至目前已成功为全国24个省市自治区的900余名先心病患儿免费实施了爱心手术，成功率100％。2013年医院与青海慈善总会、青海红十字医院达成救助协议，爱心救助走进青海，现免费救助青海先心病患儿近100例，赢得了良好的社会声誉，增强了民族情谊。医院打造的“大爱无疆”服务品牌，受到社会的广泛赞誉。近几年我院推出的社区“健康之家”的服务和辐射作用已经逐渐显现，成为我院医疗健康新的服务理念和“医院——社区新的联动模式”的具体体现。在提升社区服务能力的同时，已初步形成小病进社区，大病进医院的分级诊疗和双向转诊的格局，此项工作获得省、市卫计委、市政府的高度赞扬，获得老百姓的一致好评。
“一切为了病人”是济宁医学院附属医院对患者永远的承诺，医院将以精湛的医疗技术、优质高效的服务、规范合理的收费为患者提供满意、放心的服务，无愧于“全国百姓放心示范医院”的光荣称号。
1.济宁医学院附属医院(直属），三级甲等，就是学生所说的附院，在古槐路。目前鲁西南应该是最好的医院了。2.济宁市第一人民医院（非直属），三级甲等，以前是是济宁市最好的医院，鲁西南第一所三甲医院，健康路，现在被附院赶超。
3.枣庄市立医院（非直属），三级甲等，应该说是枣庄是最好的医院了。即济宁医学院附属枣庄医院。
4.山东省安康医院（非直属）,三级乙等，即岱庄医院又叫济宁医学院第二附属医院，是全国最大的三所精神病医院之一。
5.滕州市中心人民医院(非直属），三级乙等医院，“全国百姓放心示范医院”、“山东省惠民医院”、“山东省百佳医院”，即济宁医学院附属滕州医院。
6.单县中心医院（非直属），三级乙等，即济宁医学院附属湖西医院。
7.金乡人民医院（非直属），三级乙等，曾是鲁西南地区首家二级甲等医院，即济宁医学院附属金乡医院。
8.日照市人民医院（非直属），三级乙等，日照市最好的医院环境非常不错。即济宁医学院附属日照医院。
9.济南市第三人民医院（非直属），二级甲等，是一所集医疗、科研、教学于一体的市级综合性二级甲等医院。即济宁医学院附属济南医院。
10.高唐县人民医院（非直属），二级甲等，现为集医疗、急救、教学、科研、预防、康复于一体的二级甲等综合医院。即济宁医学院附属高唐医院。
综合来看：
1）、附属医院、济宁市第一人民医院、枣庄市立医院、滕州中心医院实力较强。
2）、岱庄医院、附属医院业内和社会的知名度较高。
3）、其他的医院都还是当地最好的医院。
应该说济宁医学院的附属的十所医院都还是实力比较雄厚的医院，教学医院也有一批不错的医院，可以保证本科见习和实习的任务。
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