一、主要病因
1、代谢异常：形成结石的成分大多是由人体代谢产物构成，不同成分的结石可以反映体内相应成分的代谢异常。尿液内常见的能够形成结石的成分包括钙、草酸、尿酸和胱氨酸等，任何生理紊乱造成成分异常都可能引起结石形成和促进结石生长。而代谢异常与形成结石的物质排出增加、尿pH的改变、尿中抑制晶体形成和聚集的物质减少、尿量减少等因素有关。
2、药物因素：长期服用可导致尿液浓度高而溶解度低的药物，包括氨苯蝶啶、茚地那韦、硅酸盐和磺胺类药物等，这些药物本身就是结石的成分，因此更加容易发生肾结石。长期服用一些诱发结石形成的药物，如乙酰唑胺、维生素D、维生素C和皮质激素等，这些药物在代谢过程中也可引起其他成分结石的形成。
3、尿路病变：各种原因引起的尿路梗阻导致尿液淤积、尿路感染，尤其是某些细菌能将尿素分解为氨，使尿液变为碱性，有利于磷酸盐、碳酸盐沉积而形成结石。此外，结石在尿路各个部位均能造成梗阻，凡能引起梗阻的结石，多可导致尿路感染。
二、诱发因素
1、气候因素：气温升高，排汗和呼吸丢失的水分增加，尿液浓缩，可促进肾结石的发生。
2、饮食习惯：水分摄入不足的患者，增加发生肾结石的风险，可促进本病的发生。
引起肾结石的原因很多，主要有1.因为代谢异常，尿液酸碱度改变，使钙盐、草酸盐、尿酸和胱氨酸等物质在肾内结晶，逐渐形成结石；2.长期服用可导致尿液浓度高而溶解度低的药物，比如氨苯蝶啶；
3.尿路梗阻狭窄；
4.生活方式或者环境因素，比如久坐久站、饮水少而出汗多、天气炎热、饮食习惯差、生活地区水质硬等。
肾结石的大多数病因，可以通过改善生活方式而消除；即使一些先天性因素，也会因为多饮水、多运动、饮食清淡等生活习惯改善而降低得得肾结石的风险。
结石形成原因目前并不清楚，常见有相性的因素如下：1、外界因素：比如地理位置、气候等因素，结石的发生特点通常南方高于北方，气候是很重要的因素，在高温条件下由于排汗增多、尿液生成增加，会导致尿液浓缩，尿液中有形成分容易析出形成结石；
2、个体因素：比如患者的饮食习惯、合并疾病等情况，某些疾病容易导致结石的发生，比如甲状旁腺功能亢进，可以导致钙磷代谢异常，从而引起结石发生。而痛风患者由于尿液中尿酸浓度升高，会诱发尿酸结石的形成，饮食方面由于过多摄入海鲜等食物，容易导致尿酸排泄增加，引起结石的形成；
3、局部因素：主要包括泌尿系统感染、梗阻和结石，三者互成因果导致疾病的复杂化。
在以上因素共同作用下，会导致尿液中成石因素增加，抑制成石因素减弱，从而导致结石的发生。
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