上榜各家医院的得分由两部分构成：“专科声誉得分（声誉排名）”以及“科研学术得分”。
“专科声誉得分”是由专家综合考虑每家医院的学科建设、临床技术与医疗质量、科研水平等关键因素后，对相关专科前10名医院进行的提名和排序。
《最佳医院排行榜》则是根据每家医院获得的各专科声誉排名，并结合该院的“医院科研学术得分”，形成医院的总体得分，最后产生全国100家最佳医院。
据复旦大学医院管理研究所所长高解春介绍，通过借鉴美国医院排行榜的评选标准，探索出适合中国的医院排名标准：来自28个专业的1359名专家，根据专科声誉、科研水平为评估内容，忽视医院规模、设备、专科差异，以学科建设、疑难杂症为主要引导方向。
2018年《中国医院专科声誉排行榜》和《中国医院排行榜》评审专家来自中华医学会和医师学会，涉及37个临床专科，向4879位专家发挂号信，收到有效回执3258份（每年有所变动）
全国儿科排名：儿内科
1、复旦大学附属儿科医院：上海市闵行区万源路399号，021-64931990
2、首都医科大学附属北京儿童医院：北京市西城区南礼士路56号，010-59616161
3、浙江大学儿童医院：杭州市下城区竹竿巷57号，0571-87061007
4、重庆医科大学附属儿童医院：重庆市渝中区中山二路136号，023-63622874
5、上海儿童医学中心：上海浦东新区东方路1678号，021-38626161
6、北京大学第一医院：北京市西城区西什库大街8号，010-83572211
7、四川大学华西附二院：成都市人民南路3段20号，028-85501322
8、上海新华医院：上海市杨浦区控江路1665号，021－55571133
9、首都儿科医学研究所：北京市朝阳区雅宝路2号，010-85695555
10、盛京医院：辽宁省沈阳市和平区三好街36号，024-96615
11、广州市妇女儿童医学中心：广州市金穗路9号，020-38076461
12、同济医院：湖北省武汉市解放大道1095号，027-83662688
13、南京市儿童医院：南京市广州路72号，025-83117500
14、湖南省儿童医院：长沙市梓园路86号，0731-85600908
15、上海市儿童医院：上海北京西路1400弄24号，021-62474880
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