内分泌科成立于八十年代。现拥有床位22张，年门急诊量30000余人次，拥有心电监护仪、胰岛素泵、手指血糖仪、尿微量白蛋白快速测定仪等先进设备。30多年来，在新老专家的共同努力下，内分泌科逐渐发展成为上海西南地区规模较大、技术力量最强的科室之一。有副主任医师3名；副教授、硕士生导师1名；主治医师3名；住院医师4名。并曾聘请了全国著名内分泌专家沙松林教授作为技术顾问全面指导业务，吸引了各地的患者慕名前来就诊。除糖尿病及其并发症的诊治外，内分泌科在其他内分泌疾病的诊疗、危重病人（如糖尿病酮症酸中毒、糖尿病非酮症高渗昏迷、甲亢危象、垂体危象、肾上腺危象、黏液性水肿等）的抢救方面积累了丰富的临床经验，并对库欣氏病、皮质醇增多症、尿崩症、胰岛细胞瘤、泌乳素瘤等较少见的内分泌疾病有独到的治疗经验。
在科研工作方面，内分泌科拥有自己的实验室。近年来共完成上海市科委、上海市卫生局、复旦大学科研基金及闵行区科委的科研课题9项。在《中华内科杂志》、《中华内分泌代谢杂志》、《中华老年医学杂志》、《复旦学报》等各类杂志上发表论著约50余篇。主编出版了1本专著，还参与了《临床实验诊断学》的撰写。在国内最早进行有关2型糖尿病一级亲属脂联素和颈动脉IMT5年随访的临床研究。1994年，内分泌科参加并完成了“全国糖尿病患病率”普查中上海闵行区的抽样普查工作；1996年，内分泌科参与完成了由中国、新加坡等多国组成的“亚洲青年糖尿病五年跟踪治疗观察”的科研课题。2003年底成立了糖尿病学校，针对广大糖尿病患者普及糖尿病的相关知识，每月举办一次讲座。内分泌科同时承担复旦大学医疗系、七年制临床医生、公共卫生系，皖南医学院医疗系和成人教育系的实习带教及理论教学任务。内分泌科还积极参与“上海广播电台”组织的糖尿病知识讲座。 复旦大学附属上海市第五人民医院神经内科是医院的重点专科之一，目前拥有固定床位34张,其中重症监护室6张,床位使用率>100%。本科配备有重症监护系统、肌电图、脑电图、诱发电位、眼震电图等固定设备及相应的医技人员。本科对脑血管病、脊髓病、周围神经病、癫痫、锥体外系疾病、肌肉疾病、各种颅内感染、头痛及眩晕病症有丰富的诊疗经验，多次因成功救治危重及疑难病例得到上级部门的嘉奖。除临床工作外，本科医师均分别承担有市、区及院级的多项科研项目，其中超早期脑梗塞的溶栓治疗成功率高，达到了市级先进水平。
神经专科原属大内科的一个专业学组，收治神经科常见病、多发病。2000年成为一个独立的病区，并经严格筛选从外院引进人才作为学科带头人，专科得到了很大的发展，医疗业务、科研实力、教学工作上了一个新的台阶，得到了病人的认可，现除接诊闵行及周边地区的病人外，还接诊了许多外省市、外区的病人。
专科现已形成了合理的人才梯队，有高级职称2名，主治医师3名，主管技师1名，主管护师2名，住院医师3名。 肾内科成立于1985年5月，是上海西南市郊成立最早的肾脏病科室，是闵行卫生局特色医疗专科，承担上海西南市郊，包括闵行区、奉贤区、金山区、松江区、浙江省及江苏省临近区县的肾脏病医疗任务，为该地区人民的健康做出了重大贡献。
目前肾内科分为门诊、病房和血液透析室三个部分，年平均普通门诊量4500余人次，专科门诊量4000余人次，专家门诊量2000余人次，尤其是专家门诊实力雄厚，顾勇教授、徐元钊教授等名医坐堂，吸引了闵行及周边地区的广大肾友就诊，从而使得我科拥有稳定的病源。病房床位25张，年住院患者500余人次，每年肾脏穿刺人数150余例次。血液透析患者90余人，年透析次数达1万余人次。
慢性肾脏疾病的规范诊治是我科的特长之一。病房主要收治原发性肾小球肾炎，肾病综合征，间质性肾炎，肾小管疾病，各种继发性肾小球疾病如红斑狼疮性肾炎、高血压性肾病、糖尿病肾病、痛风性肾病等，尿路感染（包括急、慢性肾盂肾炎，膀胱炎），各种原因所致急慢性肾功能衰竭，药物及毒物中毒。我科是闵行区率先开展B超引导下经皮肾活检术的单位，此项检查目前已成为常规项目。利用B超引导下经皮肾活检明确肾脏病理类型，不仅大大提高了我科的诊疗水平，同时为患者的个体化治疗带来了可能，并为形成临床-病理-治疗的模式提供了保证。
血液净化治疗是我科的另一特色。在上海西南市郊开展早、规模大、设备先进、患者多，净化方法齐全，技术水平高，患者存活质量好。透析室拥有透析机20台，包括德国费森尤斯4008B、德国贝朗等机型以及德国贝朗CRRT机1台。开展的业务包括血液透析、血液滤过、持续性肾脏替代治疗（CRRT）、血液灌流等。目前拥有二级反渗水的水处理系统，从源头上保证了血透患者的生活质量。透析室为病人提供精心的治疗和护理，配备彩电，为病人提供舒适、温馨的治疗环境。自开展CRRT技术以来，涉及胸外科、普外科、呼吸内科、神经内科、ICU等多个学科，为院内多学科之间危重症患者的抢救起到了非常重要的保障作用。每年均通过上海卫生监督所监测和上海市血透专业质控，对我们的透析水平和管理水平均予以良好的评价。腹膜透析（CAPD）是近年来开展的项目，目前拥有长期随访患者20余人。
肾内科在保证完成临床医疗任务的同时，重视人才梯队的建设和培养。目前共有工作人员26人，医师8人，护师18人，其中主任医师（教授）3人，主治医师2人，住院医师3人。包括博士后2人，硕士生1人，在读硕士生2人。并拥有闵行区首届科技之星1人。肾内科是我院最早成为复旦大学硕士研究生培养的科室，有博士生导师1名，硕士生导师2名，在培硕士生8名。同时承担复旦大学上海医学院七年制、皖南医学院、蚌埠医学院的临床教学任务。 2002年内科三级分科后正式设立了消化内科。随着学科的发展，建立起了一支较强的医疗技术队伍和合理的人才梯队，推动了医教研的同步发展。
消化内科八十年代开始应用纤维内镜诊治胃肠道疾病。九十年代逐渐形成消化专业队伍，进行消化专科的进修及内镜技术的培养，并积极参加国内、市内各种消化学术交流活动，并把新知识、新技术应用于临床，胃镜、肠镜、十二指肠镜的开展为消化系统疾病的诊治开创了一个新的局面。
消化内科成功地抢救了很多消化系统的疑难和危重病人，如肝硬化并出血、肝昏迷、脑水肿、多脏器功能衰竭、急性重症胰腺炎、蛋白丢失性肠病、电解质紊乱、急性肾功能衰竭、休克等及各种病因的消化道大出血等。消化内科开展了腹水回输工作，对各种原因的顽固性腹水的治疗取得良好的效果，用胃肠起搏器治疗了各种原因的胃肠动力功能障碍性疾病，疗效良好。消化内科结合临床开展了急诊胃镜检查和治疗，如食管静脉曲张并出血的硬化剂、圈套治疗，内镜下取异物、放支架、息肉摘除，开展ERCP检查和乳头肌切开取石，放置支架等高难度的诊治，在上海同级医院处于先进水平。
科室共发表论文30余篇，其中科研项目“CagA基因菌株HP检测与胃十二指肠溃疡”获98年闵行区科技成果二等奖。消化内科还承担院级、区级课题2项。 心内科隶属于大内科，1979年成立了单独的心脏监护病房（CCU病房，拥有床位5张），1999年三级分科，使心脏病的诊疗专科化。至今已发展成为拥有9名专业医师，30张床位，集科教研临床诊疗为一体的综合学科，2003年当选闵行区心血管内科特色专科。
心内科在五院独立成科较晚，但它在内科中的地位不容忽视，从上世纪50年代的郭守蔚主任、70年代的禹宝莲主任、卜国强主任、金松元主任、80-90年代的张祖茂主任，在上海西南地区都享有很高的医学地位，并曾聘请了全国著名心血管病专家浦寿月教授、何梅先教授作为技术顾问全面指导业务，吸引了各地的患者慕名前来就诊。尤其是2002年来通过引进人才和培养人才，在现今科室负责人许澎，副主任伍旭升的带领下，狠抓规范化的诊疗，使心内科的整体业务素质，诊疗水平得到大幅度的提高，同时开展了多项新技术新业务，诊疗患者数目成倍增长，危重症患者抢救成功率达95%以上，现已成为上海市西南地区规模较大、设备齐全、技术力量很强的科室，已赢得了社会的好评，在上海市心血管界也享有一定的地位。
目前心内科设有CCU病房，普通病房，心导管室，无创功能检查室，心电图室等，拥有心脏科专业医师9名，其中副主任医生3人、主治医生3人、住院医生3人，硕士及在职硕士研究生5人、并有西门子数字化心血管造影机（DSA）、计算机化多导心电生理记录仪（BARD）、惠普多中心心电监护系统等先进设备。年收治病人500余人次，门诊5000余人次，各种手术200余台。 血液内科是复旦大学附属上海市第五人民医院特色专科，病房编制床位22张，拥有独立的血液实验室，擅长诊治骨髓瘤、淋巴瘤、骨髓增生异常综合征、白血病、血小板减少性紫癜、过敏性紫癜、血友病、易栓症、各类贫血和发热原因待查等常见血液系统疾病，对骨髓瘤、骨髓增生异常综合征、白血病、血栓栓塞性疾病和出血性疾病的诊治具有一定的特色。
科室注重国内外的联系与交流。国际上，与日本国立广岛大学原爆放射线医科学研究所和加拿大McGill大学血液内科开展了国际交流与合作；上海市内与华山医院、瑞金医院、中山医院、一医、新华医院等有着密切的交流与合作，市外与武汉同济医院、协和医院、河南医科大学附属医院、广州医学院附属医院等有着广泛的联系。
现任科室主任刘立根为复旦大学上海医学院授课教授、上海市首批“医苑新星”培养对象，曾赴日本国立广岛大学研修和担任访问教授1年，具有丰富的临床经验和强烈的学术意识。血液内科现有医疗和医技人员17人，其中教授（主任医师）3名、主治医师3名、主管检验师2名、主管护师2名、初级人员7名，具有硕士学位4人。 面对老闵行区老年人群多于本市其他区县同类人群的特点、住院难较为突出为背景。得到医院各方面的重视和关注，1997年4月组建老年科、与此同时由12病区康复病床为基础进行人才和卫生资源的重新整合。2002年承担区科委课题《Ⅳ期非小细胞肺癌联合化疗对照研究》获三等奖、2003年《血管内皮生长因子与肺结核活动性的研究》、《慢性阻塞性肺病合并脑梗塞的临床研究》、《老年住院患者忧虑状况与生活质量的相关调查研究》院级课题及将进行课题鉴别和申报区级课题。多年来开展了高难度经皮肝穿刺活检术、经皮肺活检术、经皮心包穿刺化疗术。通过努力活跃了学术气氛、提高技术水平。建科以来诊断出疑难病数10例，如肝肺综合征、多动脉硬化多浆膜腔积液等。省市级以上杂志发表文章11篇。随着双水平呼吸机的应用、慢阻肺合并呼衰的缓解率大有提高。
现有医护人员17人，副主任医师2人，主治医师2名，住院医师5人(其中硕士1人)，护师8人。设定床位30张，年收治病人456人次。先后开展了4个不同学科专业门诊。拥有先进的双水平呼吸机、心肺监护仪各1台。全科医护实行部分区域性计算机管理。
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