1、江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院、江苏省红十字医院)
2、南京医科大学第二附属医院
3、江苏省中医院
4、江苏省第二中医院
5、江苏省中西医结合医院
6、江苏省肿瘤医院
7、江苏省级机关医院
8、江苏省口腔医院
9、中国医学科学院皮肤病研究所
10、东南大学附属中大医院（原南京铁道医学院）
11、南京军区南京总医院
12、中国人民解放军第八一医院
13、中国人民解放军第四五四医院
（以上为三级医院，或相应规模医院）
14、武警江苏总队南京医院
二、市属医院
1、南京市鼓楼医院（南京大学医学院附属第一医院）
2、南京市第一医院（南京医科大学附属南京第一医院）
3、南京市第二医院
4、南京脑科医院
5、南京市妇幼保健院
6、南京市儿童医院
7、南京市中医院
8、南京市口腔医院
9、南京市胸科医院
（以上为三级医院，或相应规模医院）
尤其推荐这么几家：
南京军区南京总医院，
鼓楼医院，
省人民医院，
省中医院，
市第一医院，
中大医院
综合性大学医学部，2所南京大学医学部 附属医院：鼓楼医院（三级甲等）
东南大学医学院（原铁道医学院） 附属医院：中大医院（三级甲等）
专业性医科大学，2所
南京医科大学 主要附属医院：江苏省人民医院（三级甲等）、南京医科大学附属第二医院（三级乙等）、江苏省肿瘤医院、南京市口腔医院、江苏省口腔医院、南京市脑科医院、南京市第一医院（三级甲等）、南京市儿童医院（三级甲等儿童医院）、江苏省妇幼保健医院
南京中医药大学 主要附属医院：江苏省中医院（三级甲等中医院）、江苏省第二中医院、南京市中医院（三级甲等中医院）
军队院校，1所
解放军第二军医大学南京军医学院（以培养军队医疗系统高级护理人员出名）
民办本三院校，2所
南京医科大学康达学院
南京中医药大学翰林学院
中国药科大学是药学类院校，没有医学类专业。
南京的医学类学校，在全国都只能算二流，要说实力谁弱谁强，无可比性，南医大应该是综合实力最强的，医学类学科门类全，附属医院多且医疗科研实力雄厚，但是南京大学医学部恐怕在基础医学和临床医学方面也不错。
而南京中医药大学则是中医学类院校，因为是国家中医药人才培养基地和留学生基地，因此在全国的影响力反而比南京医科大学大。
总的来说，学临床医学或基础医学，最佳是南医大和南大医学部，学中医，则是中医药大学，学药学，惟有中国药科大学！
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