一共有6个附属医院，分别为：第一附属医院、第二附属医院、第三附属医院（新疆维吾尔自治区肿瘤医院）、第四附属医院（新疆维吾尔自治区中医医院）、第五附属医院、第六附属医院（新疆维吾尔自治区骨科医院）。
新疆医科大学，坐落于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市风景秀丽的鲤鱼山下，是一所具有光荣传统的省属重点大学，入选“卓越医生教育培养计划”、“中国政府奖学金来华留学生接收院校”，是国家卫生和计划生育委员会、教育部和新疆自治区共建高校。
是由复旦大学、中山大学、中国药科大学、北京中医药大学和中南大学对口支援新疆医科大学。
学校的六所附属医院中有五所为国家三级甲等医院，能开展肝移植、试管婴儿、冠脉搭桥、骨髓移植、PTCA、三腔（心室再同步化CRT）及ICD起搏器植入技术 、房颤射频消融治疗 、成功植入全国第一例三腔双室ICD(INSYNC SENTRY) 、采用全国首例经心外膜左室电极植入三腔CRT-D、
首款可用于核磁共振系统的心脏起搏器等多项先进医疗技术。学校是获得2亿元资助的全国16个国家级中医临床研究基地建设单位之一，是教育部认定全国外语授课培养医学留学生的25所大学之一。
黄卫东，男，汉族，1967年5月出生，硕士研究生学历，新加坡国立大学EMBA，泌尿外科主任医师，新疆佳音医院、重庆佳音医院创始人、董事长。1995年起创办新疆佳音医院。 2004年，新疆佳音医院被评选为首批“全国百姓放心示范医院”，2012年再次荣获“全国百姓放心百佳示范医院”殊荣。1998年，发明“前列腺尿道注药冲洗引流导管”技术并获国家专利和重庆市科技进步奖。2000年，成功创建我国首家获得中华人民共和国卫生部人类辅助生殖技术（试管婴儿）准入资格的民营医疗机构——新疆佳音医院生殖医学中心，2010年入选国家卫生部国家临床重点专科建设项目。政协新疆维吾尔自治区十届委员会特邀委员；政协乌鲁木齐市十二届委员会委员；中国民营医院管理协会第一、二、三届委员会副主任委员；新疆医院管理学会副会长兼民营医院管理专业委员会主任委员；中华医学会生殖医学分会第一届委员会委员兼精子库管理学组成员；中华医学会男科学分会第四、五届委员会青年委员会委员；美国男科学会会员；《中华男科学杂志》第三、四届编委会和《中国医院杂志》第一、二届编委会编委。
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