氨基酸是蛋白质的基本组成单位，氨基酸分子中含有氨基和羧基两种官能团，根据R取代基团不同分为不同的氨基酸。20种蛋白质氨基酸在结构上的差别取决于侧链基团R的不同。通常根据R基团的化学结构或性质将20种氨基酸进行分类。
脂肪族氨基酸:丙、缬、亮、异亮、蛋、天冬、谷、赖、精、甘、丝、苏、半胱、天冬酰胺、谷氨酰胺
芳香族氨基酸:苯丙氨酸、酪氨酸
杂环族氨基酸:组氨酸、色氨酸
杂环亚氨基酸:脯氨酸
决定氨基酸的种类的是分子中R基的不同。根据氨基酸的结构通式可知，在氨基酸的α碳原子上都含有一个氨基，一个羧基，一个氢，和一个R基。不同种类的氨基酸，α碳上其他原子或基团都相同，只有R基不同。
所以，R基的不同决定着氨基酸的不同。
下图中红色的部分就是各种氨基酸不同的R基。
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