大部分能够运动的细菌都是依靠自身的运动器官——鞭毛的作用，鞭毛运动是细菌的一种主要的运动形式，但是还有一些细菌并不是用鞭毛运动，而且也根本找不到类似的运动器官，但它们可以在固体的表面滑动，它们有的沿着自身长轴旋转前进，有的似乎只有一面接触固体表面移动，这类细菌被称为滑行细菌，不过它们滑动的速度要比用鞭毛游动的速度慢得多，大约每秒钟向前移动三微米，细菌中的一些螺旋体（身体呈螺旋状）的运动方式也是很独特的，它们除了能在固体表面爬行或蠕动外，还能屈曲身体呈波浪形的向前运动，它们能完成这种高难度的动作，完全靠缠绕在身上的轴丝作用，不过它们是缠绕在螺旋体身上，而不是披散在身体外。一些湖泊中的水生光合细菌体内有几个到几百个蛋白质薄膜包裹的气囊，气囊的作用有点类似于鱼瓢，它可以通过充气或者放气调节菌体在水中的高度，使细菌能在最合适的水体深度进行光合作用。
细菌运动形式一般有如下两种，以下列举了它们两种运动的不同之处：①鞭毛和纤毛的运动是由于它们局部弯曲，从基部向顶端波浪式地推进的结果。由于鞭毛微管二联体的长度不变，推测这种局部弯曲是由于相邻的两根微管二联体沿长轴滑动引起的。局部滑动所需的能量是由ATP周期性水解提供的。
②变形运动既有把伪足附着在基底上的细胞移动运动（如：变形虫类。变形菌类的变形体，蛔虫的精子，脊椎动物的原始生殖细胞，淋巴球，白血球，低等无脊椎动物的排出游走细胞，成长中的神经纤维等），又有仅在摄食中使游离性伪足伸缩、屈曲的局部运动（如有孔虫类，太阳虫类，脊椎动物的网内皮系细胞，巨噬细胞等）。
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